論文の概要: A New Probabilistic V-Net Model with Hierarchical Spatial Feature
Transform for Efficient Abdominal Multi-Organ Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2208.01382v1
- Date: Tue, 2 Aug 2022 11:51:46 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-08-03 13:38:06.489569
- Title: A New Probabilistic V-Net Model with Hierarchical Spatial Feature
Transform for Efficient Abdominal Multi-Organ Segmentation
- Title(参考訳): 効率的な腹部多臓器分割のための階層的空間特徴変換を用いた新しい確率的V-Netモデル
- Authors: Minfeng Xu, Heng Guo, Jianfeng Zhang, Ke Yan, Le Lu
- Abstract要約: 本稿では, 階層的空間的特徴変調を用いた確率的多臓器分割ネットワークを提案する。
提案手法は公開されているAbdomenCT-1Kデータセットに基づいて訓練され、他の2つのオープンデータセットで評価される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.26560999964979
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: Accurate and robust abdominal multi-organ segmentation from CT imaging of
different modalities is a challenging task due to complex inter- and
intra-organ shape and appearance variations among abdominal organs. In this
paper, we propose a probabilistic multi-organ segmentation network with
hierarchical spatial-wise feature modulation to capture flexible organ semantic
variants and inject the learnt variants into different scales of feature maps
for guiding segmentation. More specifically, we design an input decomposition
module via a conditional variational auto-encoder to learn organ-specific
distributions on the low dimensional latent space and model richer organ
semantic variations that is conditioned on input images.Then by integrating
these learned variations into the V-Net decoder hierarchically via spatial
feature transformation, which has the ability to convert the variations into
conditional Affine transformation parameters for spatial-wise feature maps
modulating and guiding the fine-scale segmentation. The proposed method is
trained on the publicly available AbdomenCT-1K dataset and evaluated on two
other open datasets, i.e., 100 challenging/pathological testing patient cases
from AbdomenCT-1K fully-supervised abdominal organ segmentation benchmark and
90 cases from TCIA+&BTCV dataset. Highly competitive or superior quantitative
segmentation results have been achieved using these datasets for four abdominal
organs of liver, kidney, spleen and pancreas with reported Dice scores improved
by 7.3% for kidneys and 9.7% for pancreas, while being ~7 times faster than two
strong baseline segmentation methods(nnUNet and CoTr).
- Abstract(参考訳): 組織間および組織内形状が複雑で,腹部臓器の外観が異なっていたため,CT像からの腹腔内多臓器分画は困難である。
本稿では,階層型空間的特徴変調を用いた確率論的多臓器分割ネットワークを提案する。
More specifically, we design an input decomposition module via a conditional variational auto-encoder to learn organ-specific distributions on the low dimensional latent space and model richer organ semantic variations that is conditioned on input images.Then by integrating these learned variations into the V-Net decoder hierarchically via spatial feature transformation, which has the ability to convert the variations into conditional Affine transformation parameters for spatial-wise feature maps modulating and guiding the fine-scale segmentation.
提案手法は, 公開されているAbdomenCT-1Kデータセットに基づいて訓練し, 他の2つのオープンデータセット,すなわちAbdomenCT-1Kの患者100名, TCIA+・BTCVデータセットの患者90名を対象に評価した。
肝臓、腎臓、脾臓、膵臓の4つの腹部臓器に対するこれらのデータセットを用いて高い競争力または優れた定量的セグメンテーションの結果が得られ、Diceスコアは腎臓では7.3%、膵では9.7%向上した。
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