論文の概要: Calibrate the inter-observer segmentation uncertainty via
diagnosis-first principle
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2208.03016v1
- Date: Fri, 5 Aug 2022 07:12:24 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-08-08 13:05:57.354115
- Title: Calibrate the inter-observer segmentation uncertainty via
diagnosis-first principle
- Title(参考訳): 診断第一原理によるオブザーバ間セグメンテーションの不確かさの校正
- Authors: Junde Wu, Huihui Fang, Hoayi Xiong, Lixin Duan, Mingkui Tan, Weihua
Yang, Huiying Liu, Yanwu Xu
- Abstract要約: 本稿では, サーバ間セグメンテーションの不確実性を校正するための基準として, 診断第一原則を提案する。
さらに, 原画像からのTake and Give Modelto segment DF-GTを提案する。
実験の結果, 提案したDiFFは, 対応する疾患の診断を著しく促進できることがわかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 45.29954184893812
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: On the medical images, many of the tissues/lesions may be ambiguous. That is
why the medical segmentation is typically annotated by a group of clinical
experts to mitigate the personal bias. However, this clinical routine also
brings new challenges to the application of machine learning algorithms.
Without a definite ground-truth, it will be difficult to train and evaluate the
deep learning models. When the annotations are collected from different
graders, a common choice is majority vote. However such a strategy ignores the
difference between the grader expertness. In this paper, we consider the task
of predicting the segmentation with the calibrated inter-observer uncertainty.
We note that in clinical practice, the medical image segmentation is usually
used to assist the disease diagnosis. Inspired by this observation, we propose
diagnosis-first principle, which is to take disease diagnosis as the criterion
to calibrate the inter-observer segmentation uncertainty. Following this idea,
a framework named Diagnosis First segmentation Framework (DiFF) is proposed to
estimate diagnosis-first segmentation from the raw images.Specifically, DiFF
will first learn to fuse the multi-rater segmentation labels to a single
ground-truth which could maximize the disease diagnosis performance. We dubbed
the fused ground-truth as Diagnosis First Ground-truth (DF-GT).Then, we further
propose Take and Give Modelto segment DF-GT from the raw image. We verify the
effectiveness of DiFF on three different medical segmentation tasks: OD/OC
segmentation on fundus images, thyroid nodule segmentation on ultrasound
images, and skin lesion segmentation on dermoscopic images. Experimental
results show that the proposed DiFF is able to significantly facilitate the
corresponding disease diagnosis, which outperforms previous state-of-the-art
multi-rater learning methods.
- Abstract(参考訳): 医用画像では、多くの組織/結節が曖昧である可能性がある。
そのため、医学的なセグメンテーションは通常、個人バイアスを軽減するために臨床専門家のグループによってアノテートされる。
しかし、この臨床ルーチンは、機械学習アルゴリズムの適用にも新たな課題をもたらす。
一定の基盤構造がなければ,ディープラーニングモデルをトレーニングし,評価することは難しいだろう。
異なるグレーダからアノテーションを収集する場合、共通の選択は多数決である。
しかし、このような戦略は、学級の専門性の違いを無視する。
本稿では,キャリブレーションされたオブザーバ間不確実性を用いてセグメント化を予測するタスクについて検討する。
臨床検査では,診断支援に医用画像セグメンテーションが用いられることが多い。
この観察に触発されて,病状診断を診断基準とし,サーバ間セグメンテーションの不確かさを校正する,診断優先原則を提案する。
この考え方に従い、診断ファーストセグメンテーションフレームワーク(diff)というフレームワークを提案し、生画像から診断ファーストセグメンテーションを推定する。具体的には、diffはまず、マルチレートセグメンテーションラベルを単一のグランドルースに融合させることを学び、病気の診断性能を最大化する。
融解した接地トラスを診断ファースト接地トラス (DF-GT) と命名した。
さらに、生画像からTake and Give Modelto segment DF-GTを提案する。
基礎画像におけるOD/OCセグメンテーション,超音波画像における甲状腺結節セグメンテーション,皮膚病変セグメンテーションの3つの異なる医療セグメンテーションにおけるDiFFの有効性を検証する。
実験結果から,提案したDiFFは,従来のマルチラター学習法よりも優れる疾患診断を著しく促進できることが示された。
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