論文の概要: Continual Learning for Tumor Classification in Histopathology Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2208.03609v1
- Date: Sun, 7 Aug 2022 01:04:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-08-09 12:57:56.680140
- Title: Continual Learning for Tumor Classification in Histopathology Images
- Title(参考訳): 病理組織像における腫瘍分類の連続学習
- Authors: Veena Kaustaban, Qinle Ba, Ipshita Bhattacharya, Nahil Sobh, Satarupa
Mukherjee, Jim Martin, Mohammad Saleh Miri, Christoph Guetter, Amal
Chaturvedi
- Abstract要約: モデル忘れを緩和する継続的な学習モデルは、デジタル病理学に基づく分析で導入する必要がある。
本稿では,DP設定におけるCLシナリオを提案する。
画像の外観変化をシミュレートするために,大腸癌H&E分類のための拡張データセットを構築した。
乳腺腫瘍H&Eデータセットと大腸癌を併用し,腫瘍タイプ別にCLを評価した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Recent years have seen great advancements in the development of deep learning
models for histopathology image analysis in digital pathology applications,
evidenced by the increasingly common deployment of these models in both
research and clinical settings. Although such models have shown unprecedented
performance in solving fundamental computational tasks in DP applications, they
suffer from catastrophic forgetting when adapted to unseen data with transfer
learning. With an increasing need for deep learning models to handle ever
changing data distributions, including evolving patient population and new
diagnosis assays, continual learning models that alleviate model forgetting
need to be introduced in DP based analysis. However, to our best knowledge,
there is no systematic study of such models for DP-specific applications. Here,
we propose CL scenarios in DP settings, where histopathology image data from
different sources/distributions arrive sequentially, the knowledge of which is
integrated into a single model without training all the data from scratch. We
then established an augmented dataset for colorectal cancer H&E classification
to simulate shifts of image appearance and evaluated CL model performance in
the proposed CL scenarios. We leveraged a breast tumor H&E dataset along with
the colorectal cancer to evaluate CL from different tumor types. In addition,
we evaluated CL methods in an online few-shot setting under the constraints of
annotation and computational resources. We revealed promising results of CL in
DP applications, potentially paving the way for application of these methods in
clinical practice.
- Abstract(参考訳): 近年、デジタル病理学応用における組織像解析のための深層学習モデルの開発が盛んに行われており、これらのモデルが研究と臨床の両方に広く普及していることが証明されている。
このようなモデルは、DPアプリケーションにおける基本的な計算タスクを解く上で、前例のない性能を示したが、転送学習による見当たらないデータに適応した場合、破滅的な忘れを被る。
患者人口の進化や新たな診断検査など、常に変化するデータ分布を扱うためのディープラーニングモデルの必要性が高まっている中、モデル忘れを緩和する継続的学習モデルがdpベース分析に導入される必要がある。
しかし、我々の知る限り、DP固有のアプリケーションに対するそのようなモデルの体系的な研究は存在しない。
本稿では,DP設定におけるCLシナリオを提案する。そこでは,異なるソース/ディストリビューションからの病理像データが順次到着し,その知識を1つのモデルに統合する。
そこで我々は,大腸癌H&E分類のための拡張データセットを構築し,画像の外観変化をシミュレートし,CLモデルの性能を評価する。
乳腺腫瘍H&Eデータセットと大腸癌を併用し,腫瘍タイプ別にCLを評価した。
さらに,アノテーションや計算資源の制約の下で,オンライン数ショット設定におけるCL手法の評価を行った。
本研究は,DP応用におけるCLの有望な結果を明らかにし,臨床応用への道を開く可能性を示した。
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