論文の概要: EchoGNN: Explainable Ejection Fraction Estimation with Graph Neural
Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2208.14003v2
- Date: Sun, 23 Jul 2023 05:39:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-26 01:01:36.247805
- Title: EchoGNN: Explainable Ejection Fraction Estimation with Graph Neural
Networks
- Title(参考訳): EchoGNN: グラフニューラルネットワークによる説明可能な射出差分推定
- Authors: Masoud Mokhtari, Teresa Tsang, Purang Abolmaesumi, Renjie Liao
- Abstract要約: エジェクション分画(EF)は心機能の重要な指標であり、心不全などの心機能障害に起因した患者の識別を可能にする。
EFは、左心室を手動で追跡し、その容積を特定のフレームで推定することにより、心エコー(echo)として知られる心エコービデオから推定される。
これらの推定は、手動のプロセスと様々なビデオ品質により、サーバ間のばらつきが高い。
エコービデオからEFを推定するために,グラフニューラルネットワーク(GNN)に基づくモデルであるEchoGNNを導入する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 26.817931695658583
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Ejection fraction (EF) is a key indicator of cardiac function, allowing
identification of patients prone to heart dysfunctions such as heart failure.
EF is estimated from cardiac ultrasound videos known as echocardiograms (echo)
by manually tracing the left ventricle and estimating its volume on certain
frames. These estimations exhibit high inter-observer variability due to the
manual process and varying video quality. Such sources of inaccuracy and the
need for rapid assessment necessitate reliable and explainable machine learning
techniques. In this work, we introduce EchoGNN, a model based on graph neural
networks (GNNs) to estimate EF from echo videos. Our model first infers a
latent echo-graph from the frames of one or multiple echo cine series. It then
estimates weights over nodes and edges of this graph, indicating the importance
of individual frames that aid EF estimation. A GNN regressor uses this weighted
graph to predict EF. We show, qualitatively and quantitatively, that the
learned graph weights provide explainability through identification of critical
frames for EF estimation, which can be used to determine when human
intervention is required. On EchoNet-Dynamic public EF dataset, EchoGNN
achieves EF prediction performance that is on par with state of the art and
provides explainability, which is crucial given the high inter-observer
variability inherent in this task.
- Abstract(参考訳): エジェクション分画(EF)は心機能の重要な指標であり、心不全などの心機能障害に起因した患者の識別を可能にする。
EFは、左心室を手動で追跡し、その容積を特定のフレームで推定することにより、心エコー(echo)として知られる心エコービデオから推定される。
これらの推定は、マニュアルプロセスとビデオ品質の違いにより、オブザーバ間の可変性が高い。
このような不正確さの源泉と迅速な評価の必要性は、信頼性と説明可能な機械学習技術を必要とする。
本研究では,グラフニューラルネットワーク(GNN)に基づくモデルであるEchoGNNを導入し,エコービデオからEFを推定する。
我々のモデルはまず、1つまたは複数のエコーシン系列のフレームから潜時エコーグラフを推測する。
次に、このグラフのノードとエッジの重みを推定し、EF推定に役立つ個々のフレームの重要性を示す。
GNN回帰器はこの重み付きグラフを使用してEFを予測する。
我々は,学習グラフの重み付けが,人的介入が必要なタイミングを決定するために,EF推定のためのクリティカルフレームの同定を通じて説明可能性を提供することを示す。
EchoNet-DynamicパブリックEFデータセットでは、EchoGNNは、最先端のEF予測のパフォーマンスを達成し、説明可能性を提供する。
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