論文の概要: Understanding Graph Isomorphism Network for rs-fMRI Functional
Connectivity Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2001.03690v2
- Date: Mon, 25 May 2020 02:53:52 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-12 22:36:46.667657
- Title: Understanding Graph Isomorphism Network for rs-fMRI Functional
Connectivity Analysis
- Title(参考訳): rs-fMRI関数接続解析のためのグラフ同型ネットワークの理解
- Authors: Byung-Hoon Kim and Jong Chul Ye
- Abstract要約: グラフ同型ネットワーク(GIN)を用いてfMRIデータを解析するフレームワークを開発する。
本稿では,GINがグラフ空間における畳み込みニューラルネットワーク(CNN)の二重表現であることを示す。
我々は,提案したGINをワンホット符号化で調整するGNNに対して,CNNベースのサリエンシマップ技術を利用する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 49.05541693243502
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Graph neural networks (GNN) rely on graph operations that include neural
network training for various graph related tasks. Recently, several attempts
have been made to apply the GNNs to functional magnetic resonance image (fMRI)
data. Despite recent progresses, a common limitation is its difficulty to
explain the classification results in a neuroscientifically explainable way.
Here, we develop a framework for analyzing the fMRI data using the Graph
Isomorphism Network (GIN), which was recently proposed as a powerful GNN for
graph classification. One of the important contributions of this paper is the
observation that the GIN is a dual representation of convolutional neural
network (CNN) in the graph space where the shift operation is defined using the
adjacency matrix. This understanding enables us to exploit CNN-based saliency
map techniques for the GNN, which we tailor to the proposed GIN with one-hot
encoding, to visualize the important regions of the brain. We validate our
proposed framework using large-scale resting-state fMRI (rs-fMRI) data for
classifying the sex of the subject based on the graph structure of the brain.
The experiment was consistent with our expectation such that the obtained
saliency map show high correspondence with previous neuroimaging evidences
related to sex differences.
- Abstract(参考訳): グラフニューラルネットワーク(GNN)は、さまざまなグラフ関連タスクに対するニューラルネットワークトレーニングを含むグラフ操作に依存している。
近年,機能的磁気共鳴画像(fMRI)データにGNNを適用する試みがいくつか行われている。
近年の進歩にもかかわらず、神経科学的に説明可能な方法で分類結果を説明するのが難しいという共通の制限がある。
本稿では,グラフ分類のための強力なGNNとして最近提案されたグラフ同型ネットワーク(GIN)を用いてfMRIデータを解析するフレームワークを開発する。
本稿では,シフト演算が隣接行列を用いて定義されるグラフ空間において,ginが畳み込みニューラルネットワーク(cnn)の二重表現であることを示す。
この理解により,脳の重要領域を可視化するために,提案したGINとワンホットエンコーディングを併用したGNNのためのCNNベースのサリエンシマップ技術を利用することができる。
我々は,脳のグラフ構造に基づいて対象者の性別を分類するために,大規模静止状態fMRI(rs-fMRI)データを用いて提案フレームワークを検証した。
この実験は、得られたサリエンシマップが、性差に関連する過去の神経画像証拠と高い対応性を示すという我々の期待と一致した。
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