論文の概要: Tree-based Subgroup Discovery In Electronic Health Records:
Heterogeneity of Treatment Effects for DTG-containing Therapies
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2208.14329v1
- Date: Tue, 30 Aug 2022 15:10:38 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-08-31 13:32:45.975135
- Title: Tree-based Subgroup Discovery In Electronic Health Records:
Heterogeneity of Treatment Effects for DTG-containing Therapies
- Title(参考訳): 電子健康記録における木に基づくサブグループ発見:DTG治療における治療効果の不均一性
- Authors: Jiabei Yang, Ann W. Mwangi, Rami Kantor, Issa J. Dahabreh, Monicah
Nyambura, Allison Delong, Joseph W. Hogan and Jon A. Steingrimsson
- Abstract要約: 縦断データを用いて不均一な処理効果を持つ部分群を探索する木に基づくアルゴリズムを開発した。
本アルゴリズムを用いて,ヒト免疫不全ウイルス(HIV)のサブグループを同定し,Dolutegravirを含む抗レトロウイルス療法(ART)を受ける場合と非Dolutegravirを含むARTを受ける場合とでは体重増加のリスクが高い。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The rich longitudinal individual level data available from electronic health
records (EHRs) can be used to examine treatment effect heterogeneity. However,
estimating treatment effects using EHR data poses several challenges, including
time-varying confounding, repeated and temporally non-aligned measurements of
covariates, treatment assignments and outcomes, and loss-to-follow-up due to
dropout. Here, we develop the Subgroup Discovery for Longitudinal Data (SDLD)
algorithm, a tree-based algorithm for discovering subgroups with heterogeneous
treatment effects using longitudinal data by combining the generalized
interaction tree algorithm, a general data-driven method for subgroup
discovery, with longitudinal targeted maximum likelihood estimation. We apply
the algorithm to EHR data to discover subgroups of people living with human
immunodeficiency virus (HIV) who are at higher risk of weight gain when
receiving dolutegravir-containing antiretroviral therapies (ARTs) versus when
receiving non dolutegravir-containing ARTs.
- Abstract(参考訳): 電子健康記録(ehrs)から得られる豊富な縦長個人レベルデータは、治療効果の多様性を調べるために使用できる。
しかし, EHRデータを用いた治療効果の推定には, 時間的差異, 時間的・時間的に不整合な共変量測定, 治療課題と結果, ドロップアウトによる損失・フォローアップなど, いくつかの課題がある。
本稿では, 汎用相互作用木アルゴリズムと, グループ探索のための汎用データ駆動手法と, 縦目標最大推定法を組み合わせることで, 縦方向データを用いた不均一な処理効果を持つサブグループを探索する木系アルゴリズムであるSDLDアルゴリズムを開発した。
本アルゴリズムは,ヒト免疫不全ウイルス (HIV) のサブグループに応用され,Dolutegravirを含む抗レトロウイルス療法 (ART) を受ける場合と非Dolutegravirを含むARTを受ける場合とでは体重増加のリスクが高い。
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