論文の概要: elhmc: An R Package for Hamiltonian Monte Carlo Sampling in Bayesian
Empirical Likelihood
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2209.01289v1
- Date: Fri, 2 Sep 2022 22:22:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-07 15:14:08.796530
- Title: elhmc: An R Package for Hamiltonian Monte Carlo Sampling in Bayesian
Empirical Likelihood
- Title(参考訳): elhmc:ベイズ経験的確率によるハミルトンモンテカルロサンプリングのためのrパッケージ
- Authors: Dang Trung Kien and Neo Han Wei and Sanjay Chaudhuri
- Abstract要約: ハミルトニアン・カルロ法による経験的可能性ベース後部からのサンプルパッケージについて述べる。
MCMCサンプルは、パラメータのBayesEL後部から引き出され、ユーザによって様々な詳細が要求される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In this article, we describe a {\tt R} package for sampling from an empirical
likelihood-based posterior using a Hamiltonian Monte Carlo method. Empirical
likelihood-based methodologies have been used in Bayesian modeling of many
problems of interest in recent times. This semiparametric procedure can easily
combine the flexibility of a non-parametric distribution estimator together
with the interpretability of a parametric model. The model is specified by
estimating equations-based constraints. Drawing an inference from a Bayesian
empirical likelihood (BayesEL) posterior is challenging. The likelihood is
computed numerically, so no closed expression of the posterior exists.
Moreover, for any sample of finite size, the support of the likelihood is
non-convex, which hinders the fast mixing of many Markov Chain Monte Carlo
(MCMC) procedures. It has been recently shown that using the properties of the
gradient of log empirical likelihood, one can devise an efficient Hamiltonian
Monte Carlo (HMC) algorithm to sample from a BayesEL posterior.
The package requires the user to specify only the estimating equations, the
prior, and their respective gradients. An MCMC sample drawn from the BayesEL
posterior of the parameters, with various details required by the user is
obtained.
- Abstract(参考訳): 本稿では,ハミルトニアンモンテカルロ法を用いて,経験的確率に基づく後方からのサンプリングのための {\tt r} パッケージについて述べる。
経験的可能性に基づく方法論は、近年の多くの関心のある問題のベイズ的モデリングに用いられている。
この半パラメトリック手法は、非パラメトリック分布推定器の柔軟性とパラメトリックモデルの解釈可能性を簡単に組み合わせることができる。
モデルは方程式に基づく制約を推定することによって特定される。
ベイズ経験的可能性 (BayesEL) から推論するのは難しい。
確率は数値的に計算されるので、後部の閉じた表現は存在しない。
さらに、有限サイズの任意のサンプルに対して、可能性の支持は非凸であり、多くのマルコフ・チェイン・モンテカルロ(MCMC)手順の高速な混合を妨げる。
最近、対数経験的確率の勾配の特性を用いて、ベイズエルの後部からサンプリングするために効率的なハミルトニアンモンテカルロ(HMC)アルゴリズムを考案できることが示されている。
パッケージには、推定方程式、前者、およびそれぞれの勾配のみを指定する必要がある。
パラメータのBayesEL後部から引き出されたMCMCサンプルを、使用者が必要とする様々な詳細を得る。
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