論文の概要: Mine yOur owN Anatomy: Revisiting Medical Image Segmentation with
Extremely Limited Labels
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2209.13476v1
- Date: Tue, 27 Sep 2022 15:50:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-28 14:32:45.926881
- Title: Mine yOur owN Anatomy: Revisiting Medical Image Segmentation with
Extremely Limited Labels
- Title(参考訳): Mine yOur owN anatomy: Revising Medical Image Segmentation with Extremely Limited Labels (特集 バイオサイバネティックスとバイオサイバネティックス)
- Authors: Chenyu You, Weicheng Dai, Fenglin Liu, Haoran Su, Xiaoran Zhang,
Lawrence Staib, James S. Duncan
- Abstract要約: 我々はMine yOur owN Anatomy(MONA)と呼ばれる新しい半監督型医用画像分割フレームワークを紹介する。
まず、先行研究では、すべてのピクセルがモデルトレーニングに等しく重要であると論じており、我々はこの1つだけで意味のある解剖学的特徴を定義できないことを経験的に観察している。
第2に,医療画像を解剖学的特徴の集合に分解できるモデルを構築する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 20.390832929798577
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Recent studies on contrastive learning have achieved remarkable performance
solely by leveraging few labels in the context of medical image segmentation.
Existing methods mainly focus on instance discrimination and invariant mapping.
However, they face three common pitfalls: (1) tailness: medical image data
usually follows an implicit long-tail class distribution. Blindly leveraging
all pixels in training hence can lead to the data imbalance issues, and cause
deteriorated performance; (2) consistency: it remains unclear whether a
segmentation model has learned meaningful and yet consistent anatomical
features due to the intra-class variations between different anatomical
features; and (3) diversity: the intra-slice correlations within the entire
dataset have received significantly less attention. This motivates us to seek a
principled approach for strategically making use of the dataset itself to
discover similar yet distinct samples from different anatomical views. In this
paper, we introduce a novel semi-supervised medical image segmentation
framework termed Mine yOur owN Anatomy (MONA), and make three contributions.
First, prior work argues that every pixel equally matters to the model
training; we observe empirically that this alone is unlikely to define
meaningful anatomical features, mainly due to lacking the supervision signal.
We show two simple solutions towards learning invariances - through the use of
stronger data augmentations and nearest neighbors. Second, we construct a set
of objectives that encourage the model to be capable of decomposing medical
images into a collection of anatomical features in an unsupervised manner.
Lastly, our extensive results on three benchmark datasets with different
labeled settings validate the effectiveness of our proposed MONA which achieves
new state-of-the-art under different labeled settings.
- Abstract(参考訳): 近年のコントラスト学習の研究は, 医療画像セグメンテーションの文脈において, ほとんどラベルを活用せず, 優れた成果を上げている。
既存の手法は主にインスタンス識別と不変写像に焦点を当てている。
しかし、それらは3つの共通の落とし穴に直面している: (1) テールネス: 医療画像データは通常、暗黙のロングテールクラス分布に従う。
トレーニングですべてのピクセルを盲目的に活用することで、データの不均衡やパフォーマンスの低下につながる可能性がある。 (2) 一貫性: セグメンテーションモデルが、異なる解剖学的特徴間のクラス内変異によって有意義かつ一貫性のある解剖学的特徴を学習したかどうか、(3) 多様性: データセット全体におけるスライス内相関の注目度は大幅に低下している。
これは、異なる解剖学的視点から類似しているが異なるサンプルを発見するために、データセット自体を戦略的に利用するための原則に基づくアプローチを求める動機付けとなります。
本稿では,Mine yOur owN Anatomy (MONA) と呼ばれる新しい半教師型医用画像分割フレームワークを紹介し,その3つの貢献について述べる。
まず、先行研究は全てのピクセルがモデルトレーニングに等しく重要であると主張する。我々は、このだけでは、主に監督信号の欠如のために、有意義な解剖学的特徴を定義することは不可能であると実証的に観察する。
より強力なデータ拡張と最も近い隣人を使って、不変性を学ぶための2つの簡単なソリューションを示します。
第2に,医療画像の解剖学的特徴の集合体への分解を教師なしで行うことをモデルに促す目的の集合を構築した。
最後に,ラベル付き設定の異なる3つのベンチマークデータセットの広範な結果から,提案するmonaの有効性が検証された。
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