論文の概要: Wide Range MRI Artifact Removal with Transformers
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2210.07976v2
- Date: Mon, 17 Oct 2022 13:06:21 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-18 13:32:43.562102
- Title: Wide Range MRI Artifact Removal with Transformers
- Title(参考訳): トランスフォーマーを用いた広範囲mriアーチファクト除去
- Authors: Lennart Alexander Van der Goten, Kevin Smith
- Abstract要約: 磁気共鳴スキャンの成果は、放射線科医やコンピュータ支援診断システムにとって深刻な課題である。
そこで本研究では,原画像から8つの共通アーティファクトを遡及的に除去する手法を提案する。
提案手法は,Swin変換器によるEmphウインドウ中心アプローチを一般化した,新しいトランスベースニューラルネットワークの設計により実現された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.1305386767685186
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Artifacts on magnetic resonance scans are a serious challenge for both
radiologists and computer-aided diagnosis systems. Most commonly, artifacts are
caused by motion of the patients, but can also arise from device-specific
abnormalities such as noise patterns. Irrespective of the source, artifacts can
not only render a scan useless, but can potentially induce misdiagnoses if left
unnoticed. For instance, an artifact may masquerade as a tumor or other
abnormality. Retrospective artifact correction (RAC) is concerned with removing
artifacts after the scan has already been taken. In this work, we propose a
method capable of retrospectively removing eight common artifacts found in
native-resolution MR imagery. Knowledge of the presence or location of a
specific artifact is not assumed and the system is, by design, capable of
undoing interactions of multiple artifacts. Our method is realized through the
design of a novel volumetric transformer-based neural network that generalizes
a \emph{window-centered} approach popularized by the Swin transformer. Unlike
Swin, our method is (i) natively volumetric, (ii) geared towards dense
prediction tasks instead of classification, and (iii), uses a novel and more
global mechanism to enable information exchange between windows. Our
experiments show that our reconstructions are considerably better than those
attained by ResNet, V-Net, MobileNet-v2, DenseNet, CycleGAN and BicycleGAN.
Moreover, we show that the reconstructed images from our model improves the
accuracy of FSL BET, a standard skull-stripping method typically applied in
diagnostic workflows.
- Abstract(参考訳): 磁気共鳴スキャンの成果は、放射線医とコンピュータ支援診断システムにとって深刻な課題である。
最も一般的には、人工物は患者の動きによって引き起こされるが、ノイズパターンのようなデバイス固有の異常も引き起こされる。
ソースを無視すると、アーティファクトはスキャンを役に立たないだけでなく、もし気付かなかったら誤診断を誘発する可能性がある。
例えば、アーティファクトは腫瘍または他の異常としてマスクレードすることがある。
レトロスペクティブアーティファクト修正(RAC)は、スキャン済みのアーティファクトの除去に関するものである。
本研究では,ネイティブレゾリューションmr画像から得られた8種類のアーティファクトを遡及的に除去する手法を提案する。
特定のアーティファクトの存在や位置に関する知識は想定されておらず、システムは設計上、複数のアーティファクトの相互作用を解き放つことができる。
本手法は,swainトランスで一般化された\emph{window-centered}アプローチを一般化した,新しいボリュームトランスベースニューラルネットワークの設計により実現されている。
Swinと違って私たちの方法は
(i)ネイティブのボリューム
(ii)分類ではなく、密集した予測課題に特化し、
(iii)ウィンドウ間の情報交換を可能にするために、新規でよりグローバルな機構を用いる。
実験の結果,ResNet,V-Net,MobileNet-v2,DenseNet,CycleGAN,BicycleGANで得られたものよりも,再現性がかなり高いことがわかった。
さらに,本モデルから再構成した画像は,標準的な頭蓋骨切断法であるFSL BETの精度を向上させることを示す。
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