論文の概要: Structure-based drug design with geometric deep learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2210.11250v1
- Date: Wed, 19 Oct 2022 16:21:48 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-21 16:00:15.908746
- Title: Structure-based drug design with geometric deep learning
- Title(参考訳): 幾何学的深層学習による構造に基づく薬物設計
- Authors: Clemens Isert, Kenneth Atz, Gisbert Schneider
- Abstract要約: 構造に基づく薬物設計では、タンパク質や核酸などの高分子の3次元幾何学的情報を用いて適切な識別を行う。
ニューラルネットワークベースの機械学習の新たな概念である幾何学的深層学習は、高分子構造に応用されている。
本総説では, 生物有機化学および医薬化学における幾何学的深層学習の最近の応用について概説し, 構造に基づく創薬・設計の可能性について概説する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: Structure-based drug design uses three-dimensional geometric information of
macromolecules, such as proteins or nucleic acids, to identify suitable
ligands. Geometric deep learning, an emerging concept of neural-network-based
machine learning, has been applied to macromolecular structures. This review
provides an overview of the recent applications of geometric deep learning in
bioorganic and medicinal chemistry, highlighting its potential for
structure-based drug discovery and design. Emphasis is placed on molecular
property prediction, ligand binding site and pose prediction, and
structure-based de novo molecular design. The current challenges and
opportunities are highlighted, and a forecast of the future of geometric deep
learning for drug discovery is presented.
- Abstract(参考訳): 構造に基づく薬物設計は、タンパク質や核酸などの高分子の3次元幾何学的情報を用いて適切なリガンドを同定する。
ニューラルネットワークベースの機械学習の新たな概念である幾何学的ディープラーニングは、マクロ分子構造に応用されている。
本総説では, 有機化学および医薬化学における幾何学的深層学習の最近の応用について概説し, 構造に基づく薬物発見・設計の可能性を明らかにする。
分子特性予測、配位子結合部位とポーズ予測、構造に基づくde novo分子設計に重点が置かれている。
現在の課題と機会が強調され、薬物発見のための幾何学的深層学習の将来が予測される。
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