論文の概要: Theoretical analysis and experimental validation of volume bias of soft
Dice optimized segmentation maps in the context of inherent uncertainty
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2211.04161v1
- Date: Tue, 8 Nov 2022 11:04:52 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-09 15:07:17.197999
- Title: Theoretical analysis and experimental validation of volume bias of soft
Dice optimized segmentation maps in the context of inherent uncertainty
- Title(参考訳): 固有不確実性を考慮したソフトサイス最適化セグメンテーションマップの体積バイアスの理論解析と実験的検証
- Authors: Jeroen Bertels, David Robben, Dirk Vandermeulen, Paul Suetens
- Abstract要約: 最近のセグメンテーション法では、学習段階における損失関数の一部として、ソフトディースのような微分可能な代理計量を用いる。
まず、ボリューム推定を、潜在的に本質的に不確実または曖昧なセグメンテーションから導出する方法を簡潔に説明する。
ソフトなDice最適化は、Diceスコアやその他の測定値に対して改善された性能をもたらすが、本質的な不確実性の高いタスクに対してボリュームバイアスをもたらす可能性がある。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.692460499366963
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The clinical interest is often to measure the volume of a structure, which is
typically derived from a segmentation. In order to evaluate and compare
segmentation methods, the similarity between a segmentation and a predefined
ground truth is measured using popular discrete metrics, such as the Dice
score. Recent segmentation methods use a differentiable surrogate metric, such
as soft Dice, as part of the loss function during the learning phase. In this
work, we first briefly describe how to derive volume estimates from a
segmentation that is, potentially, inherently uncertain or ambiguous. This is
followed by a theoretical analysis and an experimental validation linking the
inherent uncertainty to common loss functions for training CNNs, namely
cross-entropy and soft Dice. We find that, even though soft Dice optimization
leads to an improved performance with respect to the Dice score and other
measures, it may introduce a volume bias for tasks with high inherent
uncertainty. These findings indicate some of the method's clinical limitations
and suggest doing a closer ad-hoc volume analysis with an optional
re-calibration step.
- Abstract(参考訳): 臨床的な関心は、典型的にはセグメンテーションに由来する構造物の体積を測定することである。
セグメンテーション法を評価・比較するために、セグメンテーションと予め定義された真実との類似性をDiceスコアなどの一般的な離散メトリクスを用いて測定する。
最近のセグメンテーション手法では、学習フェーズにおける損失関数の一部として、ソフトサイスのような微分可能なサロゲートメトリックを用いる。
本研究では,まず,本質的に不確実あるいは曖昧であるセグメント化からボリューム推定を導出する方法を簡潔に説明する。
この後、理論解析と実験的な検証が行われ、cnnの訓練における不確かさと共通の損失関数、すなわちクロスエントロピーとソフトダイスを結びつける。
ソフトなDice最適化は、Diceスコアやその他の測定値に対して改善された性能をもたらすが、本質的な不確実性の高いタスクに対してボリュームバイアスをもたらす可能性がある。
これらの結果から, 臨床上の限界が示唆され, 任意の再校正ステップでより密接なad-hocボリューム分析を行うことが示唆された。
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