論文の概要: Mind the Gap: Scanner-induced domain shifts pose challenges for
representation learning in histopathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2211.16141v1
- Date: Tue, 29 Nov 2022 12:16:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-30 17:25:11.354002
- Title: Mind the Gap: Scanner-induced domain shifts pose challenges for
representation learning in histopathology
- Title(参考訳): マインド・ザ・ギャップ:スキャンナーによるドメインシフトは病理学における表現学習に挑戦する
- Authors: Frauke Wilm, Marco Fragoso, Christof A. Bertram, Nikolas Stathonikos,
Mathias \"Ottl, Jingna Qiu, Robert Klopfleisch, Andreas Maier, Marc
Aubreville, Katharina Breininger
- Abstract要約: 自己教師付き事前トレーニングは、腫瘍セグメンテーションの下流タスクにおいて、スキャナによるドメインシフトを克服するために使用することができる。
自己教師付き事前学習が様々なスキャナー表現の整列に成功し、興味深いことに、下流タスクに限られた利益をもたらすことが示される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.309771474997404
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Computer-aided systems in histopathology are often challenged by various
sources of domain shift that impact the performance of these algorithms
considerably. We investigated the potential of using self-supervised
pre-training to overcome scanner-induced domain shifts for the downstream task
of tumor segmentation. For this, we present the Barlow Triplets to learn
scanner-invariant representations from a multi-scanner dataset with local image
correspondences. We show that self-supervised pre-training successfully aligned
different scanner representations, which, interestingly only results in a
limited benefit for our downstream task. We thereby provide insights into the
influence of scanner characteristics for downstream applications and contribute
to a better understanding of why established self-supervised methods have not
yet shown the same success on histopathology data as they have for natural
images.
- Abstract(参考訳): 病理組織学におけるコンピュータ支援システムは、これらのアルゴリズムの性能に大きな影響を与える様々な領域シフトの源によってしばしば挑戦される。
腫瘍セグメンテーションの下流タスクにおいて, スキャナによるドメインシフトを克服するために, 自己教師付きプレトレーニングを併用する可能性を検討した。
そこで本研究では,ローカル画像対応付きマルチスキャナデータセットから,スキャナ不変表現を学習するためのBarlow Tripletを提案する。
自己教師付き事前学習が様々なスキャナー表現の整列に成功し、興味深いことに、下流タスクに限られた利益をもたらすことが示される。
これにより、下流アプリケーションにおけるスキャナー特性の影響に関する知見を提供し、確立された自己監督手法が自然画像の病理学的データでまだ成功していない理由をよりよく理解する。
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