論文の概要: Automated anomaly-aware 3D segmentation of bones and cartilages in knee MR images from the Osteoarthritis Initiative

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2211.16696v1
• Date: Wed, 30 Nov 2022 02:35:05 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2022-12-01 16:30:00.142849
• Title: Automated anomaly-aware 3D segmentation of bones and cartilages in knee MR images from the Osteoarthritis Initiative
• Title（参考訳）: 変形性膝関節症のMRI画像における骨・軟骨の3次元自動計測
• Authors: Boyeong Woo, Craig Engstrom, William Baresic, Jurgen Fripp, Stuart Crozier, Shekhar S. Chandra
• Abstract要約: 膝の3次元磁気共鳴(MR)画像における異常を検出するために,U-Netベースニューラルネットワークを用いた多段階アプローチを開発した。 異常検出のために、U-Netベースのモデルが開発され、インペイントによる画像の大腿骨骨の骨の形状を再構築した。 第2の異常認識ネットワークは, 異常診断ネットワークと比較され, 大腿骨, 大腿骨, 大腿骨, パテラー骨, 軟骨の最終的な自動分割に使用された。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 3.8281328621400226
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: In medical image analysis, automated segmentation of multi-component anatomical structures, which often have a spectrum of potential anomalies and pathologies, is a challenging task. In this work, we develop a multi-step approach using U-Net-based neural networks to initially detect anomalies (bone marrow lesions, bone cysts) in the distal femur, proximal tibia and patella from 3D magnetic resonance (MR) images of the knee in individuals with varying grades of osteoarthritis. Subsequently, the extracted data are used for downstream tasks involving semantic segmentation of individual bone and cartilage volumes as well as bone anomalies. For anomaly detection, the U-Net-based models were developed to reconstruct the bone profiles of the femur and tibia in images via inpainting so anomalous bone regions could be replaced with close to normal appearances. The reconstruction error was used to detect bone anomalies. A second anomaly-aware network, which was compared to anomaly-na\"ive segmentation networks, was used to provide a final automated segmentation of the femoral, tibial and patellar bones and cartilages from the knee MR images containing a spectrum of bone anomalies. The anomaly-aware segmentation approach provided up to 58% reduction in Hausdorff distances for bone segmentations compared to the results from the anomaly-na\"ive segmentation networks. In addition, the anomaly-aware networks were able to detect bone lesions in the MR images with greater sensitivity and specificity (area under the receiver operating characteristic curve [AUC] up to 0.896) compared to the anomaly-na\"ive segmentation networks (AUC up to 0.874).
• Abstract（参考訳）: 医用画像解析では、しばしば潜在的な異常や病理のスペクトルを持つ多成分解剖構造の自動分割は難しい課題である。 本研究では, 変形性膝関節症患者の3次元磁気共鳴(MR)画像から, 遠位部, 近位部, 近位部, 膝蓋骨の異常(骨髄病変, 骨嚢胞)を早期に検出するために, U-Net-based Neural Network を用いた多段階的アプローチを開発した。 その後、抽出したデータは、個々の骨と軟骨体積のセグメンテーションと骨異常を含む下流タスクに使用される。 anomaly detectionのために、u-netベースのモデルが開発され、画像中の大腿骨と骨の骨プロファイルを塗り替えることにより、異常な骨領域を正常な外観に置き換えることができた。 再建誤差は骨異常の検出に用いられた。 anomaly-na\"ive segmentation networkと比較した第2のanomaly-aware networkは、骨異常のスペクトルを含む膝関節mr画像からの大腿骨、骨、膝蓋骨および軟骨の最終的な自動セグメント化を提供するために使用された。 Anomaly-aware segmentation(英語版)アプローチは、Anomaly-na\ive segmentation Network(英語版)の結果と比較して、Hausdorff 距離を最大58%削減した。 さらに,mr画像中の骨病変を,感度と特異性(受信者動作特性曲線[auc]下の領域が0.896まで)で検出できた。

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