論文の概要: Biomedical NER for the Enterprise with Distillated BERN2 and the Kazu
Framework
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.00223v1
- Date: Thu, 1 Dec 2022 02:07:55 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-02 15:46:04.914903
- Title: Biomedical NER for the Enterprise with Distillated BERN2 and the Kazu
Framework
- Title(参考訳): 蒸留BERN2と和フレームワークを用いた企業のためのバイオメディカルNER
- Authors: Wonjin Yoon, Richard Jackson, Elliot Ford, Vladimir Poroshin, Jaewoo
Kang
- Abstract要約: Kazuは、バイオNLPをサポートするために設計された、非常にスケーラブルなオープンソースフレームワークである。
BERN2 NERモデル(TinyBERN2)の計算効率の良いバージョンを中心に構築され、他のBioNLP技術を1つのコヒーレントシステムにラップする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.641531861117086
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In order to assist the drug discovery/development process, pharmaceutical
companies often apply biomedical NER and linking techniques over internal and
public corpora. Decades of study of the field of BioNLP has produced a plethora
of algorithms, systems and datasets. However, our experience has been that no
single open source system meets all the requirements of a modern pharmaceutical
company. In this work, we describe these requirements according to our
experience of the industry, and present Kazu, a highly extensible, scalable
open source framework designed to support BioNLP for the pharmaceutical sector.
Kazu is a built around a computationally efficient version of the BERN2 NER
model (TinyBERN2), and subsequently wraps several other BioNLP technologies
into one coherent system. KAZU framework is open-sourced:
https://github.com/AstraZeneca/KAZU
- Abstract(参考訳): 創薬・開発プロセスを支援するために、製薬会社はしばしば内外のコーパスにバイオメディカルナーとリンク技術を適用する。
BioNLPの分野の研究は、多くのアルゴリズム、システム、データセットを生み出している。
しかし、我々の経験では、現代の製薬会社の要件をすべて満たすオープンソースシステムはひとつも存在しない。
本稿では,これらの要件を業界経験に基づいて記述し,バイオNLPを医薬品業界でサポートするために設計された,高度に拡張可能なスケーラブルなオープンソースフレームワークである和について述べる。
Kazuは、BERN2 NERモデル(TinyBERN2)の計算効率の良いバージョンを中心に構築され、その後、他のBioNLP技術を1つのコヒーレントシステムにラップする。
KAZUフレームワークがオープンソースに:https://github.com/AstraZeneca/KAZU
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