論文の概要: An iterative unbiased geometric approach to identifying crystalline
order and disorder via denoising score function model
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.02421v1
- Date: Mon, 5 Dec 2022 17:18:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-06 19:35:15.163457
- Title: An iterative unbiased geometric approach to identifying crystalline
order and disorder via denoising score function model
- Title(参考訳): 点数関数モデルによる結晶秩序と乱れの同定のための反復的アンバイアス幾何学的アプローチ
- Authors: Tim Hsu, Babak Sadigh, Nicolas Bertin, Cheol Woo Park, James Chapman,
Vasily Bulatov, Fei Zhou
- Abstract要約: 固体の原子論的シミュレーションでは、熱ゆらぎの存在下で結晶相と格子欠陥を分類する能力が不可欠である。
熱雑音を除去し,基礎となる結晶秩序不規則を回復するデノナイジングスコア関数を開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.6302902879420302
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In atomistic simulations of solids, ability to classify crystal phases and
lattice defects in the presence of thermal fluctuations is essential for
gaining deeper insights into the simulated dynamics. The need for accurate and
efficient characterization methods is especially acute in presently emerging
large-scale simulations of multi-phase systems far from equilibrium. Taking the
perspective that delineating order and disorder features from ubiquitous
thermal vibrations is akin to extracting signal from noise, we consider
classification of ordered phases and identification of disordered crystal
defects to be fundamentally the same problem and address them both with a
unified approach: a denoising score function that removes thermal noise and
recovers any underlying crystalline order-disorder. Built on a rotationally
equivariant graph neural network (NequIP), the denoiser was trained entirely
with synthetically noised structures and requires no simulation data during
training. To demonstrate its denoising capabilities, the denoiser is shown to
effectively remove thermal vibrations of BCC, FCC, and HCP crystal structures
without impacting the underlying disordered defects, including point defects,
dislocations, grain boundaries, and liquid disorder. In particular the denoiser
was applied to two relatively complex MD simulations that present practical
challenges: a Cu solidification trajectory involving a polymorphic nucleus, and
a trajectory of BCC Ta undergoing plastic deformation resulting in dislocation
networks and point defect clusters. In both cases the denoiser facilitates or
trivializes the subsequent characterization of the order-disorder features.
Lastly, we outline future work to extend our denoising model to more complex
crystal structures and to multi-element systems.
- Abstract(参考訳): 固体の原子論的シミュレーションでは、熱揺らぎの存在下で結晶相と格子欠陥を分類する能力はシミュレーション力学の深い洞察を得るために不可欠である。
高精度で効率的なキャラクタリゼーション手法の必要性は、特に、平衡から遠く離れた多相系の大規模シミュレーションにおいて特に急激である。
ユビキタス熱振動から秩序と障害の特徴を抽出することは、ノイズから信号を取り出すのに似ており、秩序相の分類と乱れた結晶欠陥の同定は基本的に同じ問題であり、熱ノイズを除去し、基礎となる結晶秩序の秩序を回復するデノナイジングスコア関数(denoising score function)という統一的なアプローチで対処する。
回転同変グラフニューラルネットワーク(NequIP)上に構築され、合成ノイズ構造で完全にトレーニングされ、トレーニング中にシミュレーションデータを必要としない。
偏極性を示すために, 点欠陥, 転位, 粒界, 液体障害などの根底にある欠陥に影響を及ぼすことなく, BCC, FCC, HCP結晶構造の熱振動を効果的に除去できることが示される。
特に,ポリモルフィック核を含むCu固化軌道と,転位ネットワークと点欠陥クラスターを生じる塑性変形を受けるBCCTaの軌道の2つの比較的複雑なMDシミュレーションに適用した。
どちらの場合も、デノイザは次の順序の不順序特徴の特徴づけを促進または単純化する。
最後に,より複雑な結晶構造や多要素系へのデノナイジングモデルの拡張に向けた今後の取り組みについて概説する。
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