論文の概要: VISEM-Tracking, a human spermatozoa tracking dataset

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.02842v4
• Date: Wed, 26 Apr 2023 06:03:46 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2023-04-27 10:51:29.609060
• Title: VISEM-Tracking, a human spermatozoa tracking dataset
• Title（参考訳）: ヒト精子追跡データセットVISEM-Tracking
• Authors: Vajira Thambawita, Steven A. Hicks, Andrea M. Stor{\aa}s, Thu Nguyen, Jorunn M. Andersen, Oliwia Witczak, Trine B. Haugen, Hugo L. Hammer, P{\aa}l Halvorsen, Michael A. Riegler
• Abstract要約: 湿式精子製剤の30秒間(29,196フレームを含む)のビデオ録画を20回行うVISEM-Trackingというデータセットを提供する。 本研究では,VISEM-Trackingデータセットを用いて学習したYOLOv5ディープラーニング(DL)モデルを用いた精子検出性能について述べる。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 3.1673957150053713
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: A manual assessment of sperm motility requires microscopy observation, which is challenging due to the fast-moving spermatozoa in the field of view. To obtain correct results, manual evaluation requires extensive training. Therefore, computer-assisted sperm analysis (CASA) has become increasingly used in clinics. Despite this, more data is needed to train supervised machine learning approaches in order to improve accuracy and reliability in the assessment of sperm motility and kinematics. In this regard, we provide a dataset called VISEM-Tracking with 20 video recordings of 30 seconds (comprising 29,196 frames) of wet sperm preparations with manually annotated bounding-box coordinates and a set of sperm characteristics analyzed by experts in the domain. In addition to the annotated data, we provide unlabeled video clips for easy-to-use access and analysis of the data via methods such as self- or unsupervised learning. As part of this paper, we present baseline sperm detection performances using the YOLOv5 deep learning (DL) model trained on the VISEM-Tracking dataset. As a result, we show that the dataset can be used to train complex DL models to analyze spermatozoa.
• Abstract（参考訳）: 精子運動を手動で評価するには顕微鏡観察が必要であり、視野の速い精子の観察が困難である。 正確な結果を得るためには、手動による評価には広範な訓練が必要である。 そのため、コンピュータ支援精子分析(CASA)はクリニックでの利用が増えている。 それにもかかわらず、精子運動と運動学の評価の精度と信頼性を向上させるために、教師付き機械学習アプローチの訓練にはより多くのデータが必要である。 そこで本研究では,濡れた精子の30秒間(29,196フレームを含む)のビデオ記録を手動で注釈付き拘束箱座標で記録するVISEM-Tracking(VISEM-Tracking)というデータセットと,その領域の専門家が分析した精子特性のセットを提供する。 注釈付きデータに加えて,自己教師なし学習などの手法により,データへのアクセスと分析が容易なラベル付きビデオクリップを提供する。 本稿では,VISEM-Trackingデータセットを用いて学習したYOLOv5ディープラーニング(DL)モデルを用いた精子検出性能について述べる。 その結果、データセットは複雑なdlモデルの訓練と精子の分析に使用できることが示された。

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