論文の概要: Leveraging Natural Language Processing to Augment Structured Social
Determinants of Health Data in the Electronic Health Record
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.07538v1
- Date: Wed, 14 Dec 2022 22:51:49 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-16 16:32:51.642437
- Title: Leveraging Natural Language Processing to Augment Structured Social
Determinants of Health Data in the Electronic Health Record
- Title(参考訳): 電子健康記録における自然言語処理の活用による健康データ構造決定因子の増強
- Authors: Kevin Lybarger, Nicholas J Dobbins, Ritche Long, Angad Singh, Patrick
Wedgeworth, Ozlem Ozuner, Meliha Yetisgen
- Abstract要約: 健康の社会的決定要因(SDOH)は、個人の健康結果と健康システムの相互作用に影響を及ぼす。
医療システムは、構造化データと非構造化臨床ノートを通してSDOH情報をキャプチャする。
本研究の目的は,臨床物語からSDOHの構造的意味表現を抽出することにより,SDOH情報の獲得を可能にすることである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7812428873698403
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Objective: Social Determinants of Health (SDOH) influence personal health
outcomes and health systems interactions. Health systems capture SDOH
information through structured data and unstructured clinical notes; however,
clinical notes often contain a more comprehensive representation of several key
SDOH. The objective of this work is to assess the SDOH information gain
achievable by extracting structured semantic representations of SDOH from the
clinical narrative and combining these extracted representations with available
structured data.
Materials and Methods: We developed a natural language processing (NLP)
information extraction model for SDOH that utilizes a deep learning entity and
relation extraction architecture. In an electronic health record (EHR) case
study, we applied the SDOH extractor to a large existing clinical data set with
over 200,000 patients and 400,000 notes and compared the extracted information
with available structured data.
Results: The SDOH extractor achieved 0.86 F1 on a withheld test set. In the
EHR case study, we found 19\% of current tobacco users, 10\% of drug users, and
32\% of homeless patients only include documentation of these risk factors in
the clinical narrative.
Conclusions: Patients who are at-risk for negative health outcomes due to
SDOH may be better served if health systems are able to identify SDOH risk
factors and associated social needs. Structured semantic representations of
text-encoded SDOH information can augment existing structured, and this more
comprehensive SDOH representation can assist health systems in identifying and
addressing social needs.
- Abstract(参考訳): 目的:sdoh(social determinants of health)は、個人の健康成果や健康システムの相互作用に影響を与える。
医療システムは構造化データと非構造化臨床ノートを通してSDOH情報をキャプチャするが、臨床ノートにはいくつかの重要なSDOHのより包括的な表現が含まれていることが多い。
本研究の目的は、臨床物語からSDOHの構造的意味表現を抽出し、これらの抽出された表現を利用可能な構造化データと組み合わせることで、SDOH情報の獲得を可能にすることである。
資料と方法:我々は,深層学習エンティティと関係抽出アーキテクチャを利用したSDOHのための自然言語処理(NLP)情報抽出モデルを開発した。
電子健康記録(ehr)のケーススタディでは,20万以上の患者と40万のノートからなる大規模既存の臨床データにsdoh抽出器を適用し,抽出した情報を利用可能な構造化データと比較した。
結果: SDOH抽出器は無条件で0.86F1を達成した。
ehrのケーススタディでは、現在のタバコ使用者の19\%、薬物使用者の10\%、ホームレス患者の32\%が、これらのリスク要因の文書のみを臨床物語に含めている。
結論:SDOHによる負の健康影響のリスクがある患者は、SDOHのリスク要因と関連する社会的ニーズを特定できれば、より役に立たない可能性がある。
テキストエンコードされたSDOH情報の構造化意味表現は、既存の構造化を増強し、このより包括的なSDOH表現は、社会的ニーズを特定し、対処する健康システムを支援する。
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