論文の概要: Graph Contrastive Learning for Multi-omics Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2301.02242v1
- Date: Tue, 3 Jan 2023 10:03:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-15 22:59:06.991669
- Title: Graph Contrastive Learning for Multi-omics Data
- Title(参考訳): マルチオミクスデータのためのグラフコントラスト学習
- Authors: Nishant Rajadhyaksha and Aarushi Chitkara
- Abstract要約: 我々はMOGCL(Multi-Omics Graph Contrastive Learner)という学習フレームワークを提案する。
比較手法による事前学習と教師付き手法による微調整がマルチオミクスデータ分類の効率的な方法であることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Advancements in technologies related to working with omics data require novel
computation methods to fully leverage information and help develop a better
understanding of human diseases. This paper studies the effects of introducing
graph contrastive learning to help leverage graph structure and information to
produce better representations for downstream classification tasks for
multi-omics datasets. We present a learnining framework named Multi-Omics Graph
Contrastive Learner(MOGCL) which outperforms several aproaches for integrating
multi-omics data for supervised learning tasks. We show that pre-training graph
models with a contrastive methodology along with fine-tuning it in a supervised
manner is an efficient strategy for multi-omics data classification.
- Abstract(参考訳): オミクスデータを扱う技術の発展には、情報を完全に活用し、人間の病気をよりよく理解するための新しい計算方法が必要である。
本稿では,マルチオミクスデータセットの下流分類タスクにおいて,グラフ構造と情報を活用するためのグラフコントラスト学習の導入の効果について検討する。
我々は、教師付き学習タスクのためのマルチオミクスデータを統合するためのいくつかのアプラーチを上回り、MOGCL(Multi-Omics Graph Contrastive Learner)という学習フレームワークを提案する。
比較手法による事前学習グラフモデルと教師あり方式の微調整は,マルチオミクスデータ分類のための効率的な戦略であることを示す。
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