論文の概要: Nuclear Segmentation and Classification: On Color & Compression
Generalization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2301.03418v1
- Date: Mon, 9 Jan 2023 15:14:48 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-10 16:34:49.450716
- Title: Nuclear Segmentation and Classification: On Color & Compression
Generalization
- Title(参考訳): 核セグメンテーションと分類:色と圧縮の一般化について
- Authors: Quoc Dang Vu, Robert Jewsbury, Simon Graham, Mostafa Jahanifar, Shan E
Ahmed Raza, Fayyaz Minhas, Abhir Bhalerao, Nasir Rajpoot
- Abstract要約: この問題に対する最大の計算病理学的課題であるCoNICの課題から, 核分割・分類モデル7の堅牢性を評価する。
ドメインシフト問題に対処するために染色正規化を用いることは、モデルの性能を損なう可能性がある。
一方、ニューラルスタイルのトランスファーは、野生において大きな色のバリエーションを示す場合、テスト性能を改善するためにより一貫性がある。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.003626602732884
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Since the introduction of digital and computational pathology as a field, one
of the major problems in the clinical application of algorithms has been the
struggle to generalize well to examples outside the distribution of the
training data. Existing work to address this in both pathology and natural
images has focused almost exclusively on classification tasks. We explore and
evaluate the robustness of the 7 best performing nuclear segmentation and
classification models from the largest computational pathology challenge for
this problem to date, the CoNIC challenge. We demonstrate that existing
state-of-the-art (SoTA) models are robust towards compression artifacts but
suffer substantial performance reduction when subjected to shifts in the color
domain. We find that using stain normalization to address the domain shift
problem can be detrimental to the model performance. On the other hand, neural
style transfer is more consistent in improving test performance when presented
with large color variations in the wild.
- Abstract(参考訳): デジタルおよび計算病理学の分野として導入されて以来、アルゴリズムの臨床応用における大きな問題の1つは、トレーニングデータの分布外の例にうまく一般化することである。
病理学と自然画像の両方でこれに対処する既存の作業は、ほとんどが分類タスクに焦点を当てている。
この問題に対する最大の計算病理学的課題であるCoNICの課題から, 核分割・分類モデル7の堅牢性について検討し, 評価を行った。
既存のSoTAモデルが圧縮アーチファクトに対して堅牢であるが,カラー領域のシフトを受けると性能が著しく低下することが実証された。
ドメインシフト問題に対処するために染色正規化を用いることは、モデルの性能を損なう可能性がある。
一方、ニューラルスタイルトランスファーは、野生で大きな色の変化を示すとき、テストパフォーマンスを改善するのにより一貫性がある。
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