論文の概要: Clinical Decision Transformer: Intended Treatment Recommendation through
Goal Prompting
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2302.00612v1
- Date: Wed, 1 Feb 2023 17:26:01 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-02-02 16:58:20.607597
- Title: Clinical Decision Transformer: Intended Treatment Recommendation through
Goal Prompting
- Title(参考訳): 臨床的決定変換器 : ゴールプロンプトによる治療勧告
- Authors: Seunghyun Lee, Da Young Lee, Sujeong Im, Nan Hee Kim, Sung-Min Park
- Abstract要約: そこで本研究では,目標とする臨床状態に到達するための医薬品のシーケンスを生成するレコメンデーションシステムであるCDTを提案する。
実験では, 4788例の治療履歴を含むEHRシステムから糖尿病データセットを抽出した。
我々の知る限りでは、ゴール・プロンプトの観点から臨床レコメンデーションを探求する最初の研究である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.81521901097629
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: With recent achievements in tasks requiring context awareness, foundation
models have been adopted to treat large-scale data from electronic health
record (EHR) systems. However, previous clinical recommender systems based on
foundation models have a limited purpose of imitating clinicians' behavior and
do not directly consider a problem of missing values. In this paper, we propose
Clinical Decision Transformer (CDT), a recommender system that generates a
sequence of medications to reach a desired range of clinical states given as
goal prompts. For this, we conducted goal-conditioned sequencing, which
generated a subsequence of treatment history with prepended future goal state,
and trained the CDT to model sequential medications required to reach that goal
state. For contextual embedding over intra-admission and inter-admissions, we
adopted a GPT-based architecture with an admission-wise attention mask and
column embedding. In an experiment, we extracted a diabetes dataset from an EHR
system, which contained treatment histories of 4788 patients. We observed that
the CDT achieved the intended treatment effect according to goal prompt ranges
(e.g., NormalA1c, LowerA1c, and HigherA1c), contrary to the case with behavior
cloning. To the best of our knowledge, this is the first study to explore
clinical recommendations from the perspective of goal prompting. See
https://clinical-decision-transformer.github.io for code and additional
information.
- Abstract(参考訳): 近年,電子健康記録(EHR)システムからの大規模データを扱うために,コンテキスト認識を必要とするタスクにおいて,基礎モデルが採用されている。
しかし, 基礎モデルに基づく従来の臨床レコメンデータシステムは, 臨床医の行動を模倣する目的に限られており, 問題点を直接考慮していない。
本稿では,ゴールプロンプトとして与えられた臨床状態の望ましい範囲に達する薬の系列を生成するレコメンダシステムであるクリニカル・ディシデント・トランスフォーマ(cdt)を提案する。
そこで本研究では,今後の目標状態と治療履歴のサブシーケンスを生成し,cdtを訓練し,目標状態に達するために必要な逐次薬のモデル化を行った。
アドミッション内およびアドミッション間におけるコンテキスト埋め込みのために,入場方向のアテンションマスクとコラム埋め込みを備えたgptベースのアーキテクチャを採用した。
実験では, 4788例の治療履歴を含むEHRシステムから糖尿病データセットを抽出した。
本研究は,CDTが目的のプロンプト範囲(ノルマルA1c,ローワーA1c,ハイアーA1c)に応じて意図した治療効果を達成したことを観察した。
私たちの知識を最大限に活用するために、ゴールプロンプトの観点から臨床推奨を探求する最初の研究です。
コードと追加情報については、https://clinical-decision-transformer.github.ioを参照。
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