論文の概要: Brain Effective Connectome based on fMRI and DTI Data: Bayesian Causal
Learning and Assessment
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2302.05451v1
- Date: Fri, 10 Feb 2023 22:47:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-02-14 20:14:00.271950
- Title: Brain Effective Connectome based on fMRI and DTI Data: Bayesian Causal
Learning and Assessment
- Title(参考訳): fMRIとDTIデータに基づく脳効果コネクトーム:ベイジアン因果学習と評価
- Authors: Abdolmahdi Bagheri, Mahdi Dehshiri, Yamin Bagheri, Alireza
Akhondi-Asl, Babak Nadjar Araabi
- Abstract要約: 現在のEC発見法は、fMRIデータの短いサンプルサイズと時間分解能に制約されている。
我々は,EC発見の最も信頼性が高く正確な方法として,ベイズカジュアルな2つの発見フレームワークを紹介した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.5699418622016945
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The ambitious goal of neuroscientific studies is to find an accurate and
reliable brain Effective Connectome (EC). Although current EC discovery methods
have contributed to our understanding of brain organization, their performances
are severely constrained by the short sample size and poor temporal resolution
of fMRI data, and high dimensionality of the brain connectome. By leveraging
the DTI data as prior knowledge, we introduce two Bayesian casual discovery
frameworks -- the Bayesian GOLEM (BGOLEM) and Bayesian FGES (BFGES) methods --
as the most reliable and accurate methods in discovering EC that address the
shortcomings of the current causal discovery methods in discovering ECs based
on only fMRI data. Through a series of simulation studies on synthetic and
hybrid (DTI of the Human Connectome Project (HCP) subjects and synthetic fMRI)
data, we first demonstrate the effectiveness and importance of the proposed
methods in discovering EC. We also introduce the Pseudo False Discovery Rate
(PFDR) as a new accuracy metric for causal discovery in the brain and show that
our Bayesian methods achieve higher accuracy than traditional methods on
empirical data (DTI and fMRI of the Human Connectome Project (HCP) subjects).
Additionally, we measure the reliability of discovered ECs using the
Rogers-Tanimoto index for test-retest data and show that our Bayesian methods
provide significantly more reproducible ECs compared to traditional methods.
- Abstract(参考訳): 神経科学研究の野心的な目標は、正確で信頼性の高い脳効果コネクトーム(EC)を見つけることである。
現在の心電図発見法は脳組織の理解に寄与しているが,fMRIデータの短いサンプルサイズと時間分解能,脳コネクトームの高次元性により,その性能は著しく制約されている。
DTIデータを事前の知識として活用することにより、fMRIデータのみに基づくECの発見における現在の因果発見手法の欠点に対処する最も信頼性が高く正確な方法として、ベイズ的GOLEM(BGOLEM)とベイズ的FGES(BFGES)の2つのカジュアル発見フレームワークを導入する。
人工およびハイブリッド(ヒトコネクトームプロジェクト(hcp)被験者のdti)データと合成fmriデータに関する一連のシミュレーション研究を通じて,ecの発見における提案手法の有効性と重要性を実証した。
我々はまた、Pseudo False Discovery Rate (PFDR) を脳の因果発見のための新しい精度指標として導入し、ベイズ法が従来の経験的データ(Human Connectome Project (HCP) のDTI法とfMRI法よりも高い精度を達成することを示す。
さらに,rogers-tanimotoインデックスを用いて検出されたecsの信頼性を測定し,従来の手法に比べてベイズ法の方が再現性が高いことを示す。
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