論文の概要: AI pipeline for accurate retinal layer segmentation using OCT 3D images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2302.07806v1
- Date: Wed, 15 Feb 2023 17:46:32 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-02-16 14:22:27.037486
- Title: AI pipeline for accurate retinal layer segmentation using OCT 3D images
- Title(参考訳): OCT 3D画像を用いた正確な網膜層分割のためのAIパイプライン
- Authors: Mayank Goswami
- Abstract要約: いくつかの古典的およびAIベースのアルゴリズムが組み合わせてテストされ、動物イメージングシステムからのデータとの互換性を確認している。
単純で実装可能な解析方程式は、平均ピクセル値の1%インクリメントで輝度操作に有効であることが示されている。
厚み推定処理は、手動の注釈付き標準データと比較して6%の誤差を有する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.938455123895825
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Image data set from a multi-spectral animal imaging system is used to address
two issues: (a) registering the oscillation in optical coherence tomography
(OCT) images due to mouse eye movement and (b) suppressing the shadow region
under the thick vessels/structures. Several classical and AI-based algorithms
in combination are tested for each task to see their compatibility with data
from the combined animal imaging system. Hybridization of AI with optical flow
followed by Homography transformation is shown to be working (correlation
value>0.7) for registration. Resnet50 backbone is shown to be working better
than the famous U-net model for shadow region detection with a loss value of
0.9. A simple-to-implement analytical equation is shown to be working for
brightness manipulation with a 1% increment in mean pixel values and a 77%
decrease in the number of zeros. The proposed equation allows formulating a
constraint optimization problem using a controlling factor {\alpha} for
minimization of number of zeros, standard deviation of pixel value and
maximizing the mean pixel value. For Layer segmentation, the standard U-net
model is used. The AI-Pipeline consists of CNN, Optical flow, RCNN, pixel
manipulation model, and U-net models in sequence. The thickness estimation
process has a 6% error as compared to manual annotated standard data.
- Abstract(参考訳): マルチスペクトル動物イメージングシステムによる画像データセットは,2つの問題に対処するために用いられる。
(a)マウス眼球運動及び眼球運動による光コヒーレンス断層撮影(OCT)画像における発振の登録
b)厚い容器・構造物の陰影領域を抑制すること。
動物イメージングシステムを組み合わせたデータとの互換性を確認するために、複数の古典的およびAIベースのアルゴリズムを組み合わせて各タスクをテストする。
光フローによるAIのハイブリッド化とホログラフィー変換は、登録のために動作する(相関値>0.7)。
Resnet50のバックボーンは、損失値0.9の有名なU-netモデルよりも優れていることが示されている。
簡単な実装による分析式は、平均画素値の1%増分と零点数の77%減の明るさ操作に取り組んでいることが示されている。
提案する方程式は、ゼロ数の最小化、ピクセル値の標準偏差、平均画素値の最大化のための制御因子 {\alpha} を用いて制約最適化問題を定式化することができる。
Layerセグメンテーションでは、標準のU-netモデルが使用される。
aiパイプラインはcnn、optical flow、rcnn、ピクセル操作モデル、u-netモデルで構成される。
厚み推定プロセスは、手動の注釈付き標準データと比較して6%の誤差がある。
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