論文の概要: FlowReg: Fast Deformable Unsupervised Medical Image Registration using
Optical Flow
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2101.09639v1
- Date: Sun, 24 Jan 2021 03:51:34 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-03-19 09:08:46.578166
- Title: FlowReg: Fast Deformable Unsupervised Medical Image Registration using
Optical Flow
- Title(参考訳): FlowReg:光フローを用いた高速変形不能な医用画像登録
- Authors: Sergiu Mocanu, Alan R. Moody, April Khademi
- Abstract要約: FlowRegは、ニューロイメージングアプリケーションのための教師なしイメージ登録のためのフレームワークである。
flowregは解剖学と病理の形状と構造を維持しながら、強度と空間的類似性を得ることができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.09167082845109438
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We propose FlowReg, a deep learning-based framework for unsupervised image
registration for neuroimaging applications. The system is composed of two
architectures that are trained sequentially: FlowReg-A which affinely corrects
for gross differences between moving and fixed volumes in 3D followed by
FlowReg-O which performs pixel-wise deformations on a slice-by-slice basis for
fine tuning in 2D. The affine network regresses the 3D affine matrix based on a
correlation loss function that enforces global similarity. The deformable
network operates on 2D image slices based on the optical flow network
FlowNet-Simple but with three loss components. The photometric loss minimizes
pixel intensity differences differences, the smoothness loss encourages similar
magnitudes between neighbouring vectors, and a correlation loss that is used to
maintain the intensity similarity between fixed and moving image slices. The
proposed method is compared to four open source registration techniques ANTs,
Demons, SE, and Voxelmorph. In total, 4643 FLAIR MR imaging volumes are used
from dementia and vascular disease cohorts, acquired from over 60 international
centres with varying acquisition parameters. A battery of quantitative novel
registration validation metrics are proposed that focus on the structural
integrity of tissues, spatial alignment, and intensity similarity. Experimental
results show FlowReg (FlowReg-A+O) performs better than iterative-based
registration algorithms for intensity and spatial alignment metrics with a
Pixelwise Agreement of 0.65, correlation coefficient of 0.80, and Mutual
Information of 0.29. Among the deep learning frameworks, FlowReg-A or
FlowReg-A+O provided the highest performance over all but one of the metrics.
Results show that FlowReg is able to obtain high intensity and spatial
similarity while maintaining the shape and structure of anatomy and pathology.
- Abstract(参考訳): 神経画像アプリケーションのための教師なし画像登録のためのディープラーニングベースのフレームワークであるflowregを提案する。
システムは、連続的にトレーニングされる2つのアーキテクチャで構成されている。3Dにおける移動量と固定ボリュームの全体差を親和的に補正するFlowReg-Aと、2Dにおける微調整のためにスライス・バイ・スライスベースで画素方向の変形を実行するFlowReg-Oである。
アフィンネットワークは、大域的類似性を強制する相関損失関数に基づいて、3Dアフィン行列を回帰する。
変形可能なネットワークは、光フローネットワークFlowNet-Simpleに基づく2次元画像スライスで動作するが、3つの損失成分を持つ。
測光損失は画素強度差を最小化し、滑らかさ損失は隣接ベクトル間の等等等級を奨励し、固定画像スライスと移動画像スライス間の強度類似性を維持するために用いられる相関損失を助長する。
提案手法は,ANT,Demons,SE,Voxelmorphの4つのオープンソース登録手法と比較した。
総計で4643個のFLAIR MR画像が認知症と血管疾患コホートから使用され、60以上の国際センターから取得され、取得パラメータは様々である。
組織の構造的整合性,空間的アライメント,強度類似性に着目した,定量的な新規登録評価指標の電池を提案する。
実験の結果,flowreg (flowreg-a+o) は,0.65の画素分割,0.80の相関係数,0.29の相互情報で,強度・空間アライメント指標に対する反復型登録アルゴリズムよりも優れた性能を示した。
ディープラーニングフレームワークのうち、FlowReg-AまたはFlowReg-A+Oは、メトリクスの1つを除いて、最高パフォーマンスを提供した。
その結果,flowregは解剖学と病理学の形状と構造を維持しつつ,強度と空間的類似性を得ることができることがわかった。
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