論文の概要: Brainomaly: Unsupervised Neurologic Disease Detection Utilizing
Unannotated T1-weighted Brain MR Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2302.09200v3
- Date: Thu, 17 Aug 2023 01:31:10 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-23 01:34:29.784663
- Title: Brainomaly: Unsupervised Neurologic Disease Detection Utilizing
Unannotated T1-weighted Brain MR Images
- Title(参考訳): 脳腫瘍:T1強調画像を用いた無監督神経疾患検出
- Authors: Md Mahfuzur Rahman Siddiquee, Jay Shah, Teresa Wu, Catherine Chong,
Todd J. Schwedt, Gina Dumkrieger, Simona Nikolova, and Baoxin Li
- Abstract要約: 本稿では神経疾患検出に特化して設計されたGANを用いた画像・画像翻訳手法であるBrainomalyを提案する。
脳腫瘍は、神経画像に適した調整された画像と画像の翻訳を提供するだけでなく、注釈のない混合画像を活用して、より優れた神経疾患検出を実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.441810020877371
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Harnessing the power of deep neural networks in the medical imaging domain is
challenging due to the difficulties in acquiring large annotated datasets,
especially for rare diseases, which involve high costs, time, and effort for
annotation. Unsupervised disease detection methods, such as anomaly detection,
can significantly reduce human effort in these scenarios. While anomaly
detection typically focuses on learning from images of healthy subjects only,
real-world situations often present unannotated datasets with a mixture of
healthy and diseased subjects. Recent studies have demonstrated that utilizing
such unannotated images can improve unsupervised disease and anomaly detection.
However, these methods do not utilize knowledge specific to registered
neuroimages, resulting in a subpar performance in neurologic disease detection.
To address this limitation, we propose Brainomaly, a GAN-based image-to-image
translation method specifically designed for neurologic disease detection.
Brainomaly not only offers tailored image-to-image translation suitable for
neuroimages but also leverages unannotated mixed images to achieve superior
neurologic disease detection. Additionally, we address the issue of model
selection for inference without annotated samples by proposing a pseudo-AUC
metric, further enhancing Brainomaly's detection performance. Extensive
experiments and ablation studies demonstrate that Brainomaly outperforms
existing state-of-the-art unsupervised disease and anomaly detection methods by
significant margins in Alzheimer's disease detection using a publicly available
dataset and headache detection using an institutional dataset. The code is
available from https://github.com/mahfuzmohammad/Brainomaly.
- Abstract(参考訳): 医用画像領域におけるディープニューラルネットワークのパワーの活用は、大きな注釈付きデータセット、特に、高いコスト、時間、アノテーションの労力を伴うまれな疾患の獲得が困難であるため、困難である。
異常検出などの教師なしの疾患検出手法は、これらのシナリオにおける人間の労力を大幅に削減することができる。
異常検出は通常、健康な被験者の画像からのみ学習することに焦点を当てるが、実世界の状況は、健康な被験者と病気のある被験者の混合で注釈のないデータセットをしばしば提示する。
近年の研究では、このような注釈のない画像を利用することで、教師なしの疾患や異常検出を改善することが示されている。
しかし、これらの手法は登録された神経画像に固有の知識を利用せず、神経疾患の検出において劣等な性能をもたらす。
この限界に対処するため,神経疾患検出に特化して設計されたGANを用いた画像・画像翻訳法であるBrainomalyを提案する。
脳腫瘍は、神経画像に適した調整された画像と画像の翻訳を提供するだけでなく、注釈のない混合画像を利用してより優れた神経疾患検出を実現する。
さらに、擬似AUCメトリクスを提案することで、注釈付きサンプルのない推論のためのモデル選択の問題に対処し、Brainomalyの検出性能をさらに向上する。
広範囲な実験とアブレーション研究により、脳腫瘍はアルツハイマー病検出における有意なマージンと機関データセットを用いた頭痛検出によって、既存の最先端の非教師なし疾患や異常検出方法よりも優れていることが示されている。
コードはhttps://github.com/mahfuzmohammad/Brainomalyから入手できる。
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