論文の概要: Automated Peripancreatic Vessel Segmentation and Labeling Based on
Iterative Trunk Growth and Weakly Supervised Mechanism
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.02967v1
- Date: Mon, 6 Mar 2023 08:51:01 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-07 16:42:19.719149
- Title: Automated Peripancreatic Vessel Segmentation and Labeling Based on
Iterative Trunk Growth and Weakly Supervised Mechanism
- Title(参考訳): 反復的トランク成長と弱監視機構に基づく膵周囲血管分画とラベル付けの自動化
- Authors: Liwen Zou, Zhenghua Cai, Liang Mao, Ziwei Nie, Yudong Qiu and Xiaoping
Yang
- Abstract要約: 本稿では, 膵外静脈分節機能を改善するために, 膵外静脈分節機能向上のためのAPESAフレームワークを提案する。
提案したITGMは一連のトランク成長モジュールから構成されており,それぞれが基本容器予測の最も信頼性の高いトランクを選択する。
提案するWSLMは、疑似分岐アノテーションを生成するための教師なしルールベースの前処理と、voxelによる分岐分布のボクセルを学習するための解剖学的ラベリングネットワークから構成される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 9.145118456817945
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Peripancreatic vessel segmentation and anatomical labeling play extremely
important roles to assist the early diagnosis, surgery planning and prognosis
for patients with pancreatic tumors. However, most current techniques cannot
achieve satisfactory segmentation performance for peripancreatic veins and
usually make predictions with poor integrity and connectivity. Besides,
unsupervised labeling algorithms cannot deal with complex anatomical variation
while fully supervised methods require a large number of voxel-wise annotations
for training, which is very labor-intensive and time-consuming. To address
these problems, we propose our Automated Peripancreatic vEssel Segmentation and
lAbeling (APESA) framework, to not only highly improve the segmentation
performance for peripancreatic veins, but also efficiently identify the
peripancreatic artery branches. There are two core modules in our proposed
APESA framework: iterative trunk growth module (ITGM) for vein segmentation and
weakly supervised labeling mechanism (WSLM) for artery branch identification.
Our proposed ITGM is composed of a series of trunk growth modules, each of
which chooses the most reliable trunk of a basic vessel prediction by the
largest connected constraint, and seeks for the possible growth branches by
branch proposal network. Our designed iterative process guides the raw trunk to
be more complete and fully connected. Our proposed WSLM consists of an
unsupervised rule-based preprocessing for generating pseudo branch annotations,
and an anatomical labeling network to learn the branch distribution voxel by
voxel. We achieve Dice of 94.01% for vein segmentation on our collected
dataset, which boosts the accuracy by nearly 10% compared with the
state-of-the-art methods. Additionally, we also achieve Dice of 97.01% on
segmentation and competitive performance on anatomical labeling for
peripancreatic arteries.
- Abstract(参考訳): 膵腫瘍の早期診断,手術計画,予後の補助には,膵周囲血管分画と解剖学的標識が極めて重要な役割を担っている。
しかしながら、現在のほとんどの技術は、膵静脈の十分なセグメンテーション性能を達成できず、通常は整合性や接続性に乏しい予測を行う。
さらに、教師なしのラベリングアルゴリズムは複雑な解剖学的変異には対処できないが、教師なしの手法はトレーニングのために大量のvoxel-wiseアノテーションを必要とする。
これらの課題に対処するため, 膵静脈の分節性能を向上するだけでなく, 膵動脈枝の同定も効果的に行うために, 膵動静脈分節とlAbeling(APESA)フレームワークを提案する。
APESA フレームワークには2つのコアモジュールがある: 静脈分節に対する反復的トランク成長モジュール (ITGM) と動脈枝同定のための弱い教師付きラベル機構 (WSLM) である。
提案したITGMは一連のトランク成長モジュールから構成されており,各モジュールは最大連結制約による基本容器予測の最も信頼性の高いトランクを選択し,分岐提案ネットワークによる成長分岐の可能性を探っている。
私たちの設計した反復プロセスは、生のトランクをより完全かつ完全に接続するように導きます。
提案するWSLMは、疑似分岐アノテーションを生成するための教師なしルールベースの前処理と、voxelによる分岐分布のボクセルを学習するための解剖学的ラベリングネットワークから構成される。
収集したデータセットの静脈分画の94.01%をdiceで達成し,最先端法と比較して精度を10%近く向上させた。
また,膵動脈の解剖学的ラベリングにおけるセグメンテーションと競争性能の97.01%のDiceも達成した。
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