論文の概要: Active Learning Based Domain Adaptation for Tissue Segmentation of
Histopathological Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.05225v1
- Date: Thu, 9 Mar 2023 13:03:01 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-10 15:00:50.991823
- Title: Active Learning Based Domain Adaptation for Tissue Segmentation of
Histopathological Images
- Title(参考訳): 組織像の組織分割のためのアクティブラーニングに基づくドメイン適応
- Authors: Saul Fuster, Farbod Khoraminia, Trygve Eftest{\o}l, Tahlita C.M.
Zuiverloon, Kjersti Engan
- Abstract要約: 対象ドメインからラベル付きデータの小さなセットを使用して,次にラベル付けする最も情報性の高いサンプルを選択する,事前学習されたディープニューラルネットワークを提案する。
従来のF1スコアを用いた教師あり学習手法と比較して,本手法はラベル付きサンプルよりもはるかに少ない性能を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.4724454726700604
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Accurate segmentation of tissue in histopathological images can be very
beneficial for defining regions of interest (ROI) for streamline of diagnostic
and prognostic tasks. Still, adapting to different domains is essential for
histopathology image analysis, as the visual characteristics of tissues can
vary significantly across datasets. Yet, acquiring sufficient annotated data in
the medical domain is cumbersome and time-consuming. The labeling effort can be
significantly reduced by leveraging active learning, which enables the
selective annotation of the most informative samples. Our proposed method
allows for fine-tuning a pre-trained deep neural network using a small set of
labeled data from the target domain, while also actively selecting the most
informative samples to label next. We demonstrate that our approach performs
with significantly fewer labeled samples compared to traditional supervised
learning approaches for similar F1-scores, using barely a 59\% of the training
set. We also investigate the distribution of class balance to establish
annotation guidelines.
- Abstract(参考訳): 組織像の正確な分節化は、診断および予後タスクの合理化のために関心領域(ROI)を定義するのに非常に有用である。
しかし、組織の視覚的特徴はデータセットによって大きく異なるため、組織像解析には異なる領域への適応が不可欠である。
しかし、医療領域で十分な注釈付きデータを取得するのは面倒で時間がかかる。
アクティブラーニングを活用することでラベル付けの労力を大幅に削減することができ、最も情報に富んだサンプルの選択的アノテーションを可能にする。
提案手法では,対象領域からのラベル付きデータの小さなセットを用いて,事前学習したディープニューラルネットワークを微調整すると同時に,次にラベル付けする最も有益なサンプルを積極的に選択する。
類似したf1-scoreに対する従来の教師付き学習手法に比べて,トレーニングセットの59\%しか使用せず,ラベル付きサンプルを有意に少ない精度で実施できることを実証した。
また,授業バランスの分布を調査し,ガイドラインを確立する。
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