論文の概要: CAD-RADS scoring of coronary CT angiography with Multi-Axis Vision
Transformer: a clinically-inspired deep learning pipeline
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2304.07277v1
- Date: Fri, 14 Apr 2023 17:41:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-04-17 12:51:19.274894
- Title: CAD-RADS scoring of coronary CT angiography with Multi-Axis Vision
Transformer: a clinically-inspired deep learning pipeline
- Title(参考訳): Multi-Axis Vision Transformer を用いた CAD-RADS による冠動脈造影
- Authors: Alessia Gerbasi, Arianna Dagliati, Giuseppe Albi, Mattia Chiesa,
Daniele Andreini, Andrea Baggiano, Saima Mushtaq, Gianluca Pontone, Riccardo
Bellazzi, Gualtiero Colombo
- Abstract要約: 本研究は、冠状動脈疾患スクリーニングのための意思決定支援システムとして使用される完全自動化され、視覚的に説明可能なディープラーニングパイプラインを提案する。
The pipeline pre-processs multiplanar projections of the coronary artery, extract from the original Coronary Computed Tomography Angiography (CCTA)
3大冠動脈の2次元縦断断面をチャネル次元に沿って重ねることで、患者当たりのスコアを割り当てるように訓練されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.5366236361669898
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: The standard non-invasive imaging technique used to assess the severity and
extent of Coronary Artery Disease (CAD) is Coronary Computed Tomography
Angiography (CCTA). However, manual grading of each patient's CCTA according to
the CAD-Reporting and Data System (CAD-RADS) scoring is time-consuming and
operator-dependent, especially in borderline cases. This work proposes a fully
automated, and visually explainable, deep learning pipeline to be used as a
decision support system for the CAD screening procedure. The pipeline performs
two classification tasks: firstly, identifying patients who require further
clinical investigations and secondly, classifying patients into subgroups based
on the degree of stenosis, according to commonly used CAD-RADS thresholds. The
pipeline pre-processes multiplanar projections of the coronary arteries,
extracted from the original CCTAs, and classifies them using a fine-tuned
Multi-Axis Vision Transformer architecture. With the aim of emulating the
current clinical practice, the model is trained to assign a per-patient score
by stacking the bi-dimensional longitudinal cross-sections of the three main
coronary arteries along channel dimension. Furthermore, it generates visually
interpretable maps to assess the reliability of the predictions. When run on a
database of 1873 three-channel images of 253 patients collected at the Monzino
Cardiology Center in Milan, the pipeline obtained an AUC of 0.87 and 0.93 for
the two classification tasks, respectively. According to our knowledge, this is
the first model trained to assign CAD-RADS scores learning solely from patient
scores and not requiring finer imaging annotation steps that are not part of
the clinical routine.
- Abstract(参考訳): 冠動脈疾患(cad)の重症度と程度を評価するための標準的な非侵襲的イメージング技術は、冠動脈ctアンギオグラフィー(ccta)である。
しかし, CAD-RADS(CAD-Reporting and Data System, CAD-RADS)による各患者のCCTAの経時的評価は, 特に境界症例では時間と操作者に依存している。
本研究はCADスクリーニング手順の意思決定支援システムとして使用される完全自動化された視覚的に説明可能なディープラーニングパイプラインを提案する。
一般的に使用されるCAD-RADS閾値によると、パイプラインは2つの分類タスクを実行する: 第一に、さらなる臨床試験を必要とする患者を識別し、第二に、患者を狭窄度に基づいてサブグループに分類する。
このパイプラインは、オリジナルのCCTAから抽出された冠状動脈の多平面投影を前処理し、微調整された多軸視覚変換器アーキテクチャを用いて分類する。
現在の臨床実践をエミュレートする目的で, 3つの主冠動脈の2次元縦断断面をチャネル次元に沿って積み重ねることで, 患者毎のスコアを割り当てるように訓練した。
さらに、予測の信頼性を評価するために視覚的に解釈可能な地図を生成する。
1873年にミラノのMonzino Cardiology Centerで収集された253人の患者の3チャンネル画像のデータベース上で走行すると、パイプラインは2つの分類タスクに対してそれぞれ0.87と0.93のAUCを得た。
我々の知る限り、CAD-RADSスコアを患者スコアのみから学習し、臨床ルーチンの一部ではないより微細な画像アノテーションステップを必要としないよう訓練された最初のモデルである。
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