論文の概要: CAMIL: Context-Aware Multiple Instance Learning for Whole Slide Image
Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.05314v1
- Date: Tue, 9 May 2023 10:06:37 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-10 13:06:14.578672
- Title: CAMIL: Context-Aware Multiple Instance Learning for Whole Slide Image
Classification
- Title(参考訳): CAMIL:全スライド画像分類のためのコンテキスト対応マルチインスタンス学習
- Authors: Olga Fourkioti, Avi Arampatzis, Chen Jin, Mat De Vries, Chris Bakal
- Abstract要約: がん診断は通常、ヒト病理学者が腫瘍細胞とそのサブタイプを特定するために組織断面生検の全スライド画像(WSI)を調べる。
弱い教師付きアプローチでは、各タイルに割り当てられた注意スコアに基づいて、WSIの全体分類に基づいて、イメージサブセクションまたはタイルを入力として使用することが多い。
この方法は、腫瘍が不均一である可能性があるため、偽陽性/陰性の可能性を見落としている。
我々はこの制限に対処するため、CHARMと呼ばれる新しいディープラーニングプーリング演算子を開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.096626056612224
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Cancer diagnoses typically involve human pathologists examining whole slide
images (WSIs) of tissue section biopsies to identify tumor cells and their
subtypes. However, artificial intelligence (AI)-based models, particularly
weakly supervised approaches, have recently emerged as viable alternatives.
Weakly supervised approaches often use image subsections or tiles as input,
with the overall classification of the WSI based on attention scores assigned
to each tile. However, this method overlooks the potential for false
positives/negatives because tumors can be heterogeneous, with cancer and normal
cells growing in patterns larger than a single tile. Such errors at the tile
level could lead to misclassification at the tumor level. To address this
limitation, we developed a novel deep learning pooling operator called CHARM
(Contrastive Histopathology Attention Resolved Models). CHARM leverages the
dependencies among single tiles within a WSI and imposes contextual constraints
as prior knowledge to multiple instance learning models. We tested CHARM on the
subtyping of non-small cell lung cancer (NSLC) and lymph node (LN) metastasis,
and the results demonstrated its superiority over other state-of-the-art weakly
supervised classification algorithms. Furthermore, CHARM facilitates
interpretability by visualizing regions of attention.
- Abstract(参考訳): がん診断は通常、ヒト病理学者が腫瘍細胞とそのサブタイプを特定するために組織断面生検の全スライド画像(WSI)を調べる。
しかし、人工知能(AI)ベースのモデル、特に弱い教師付きアプローチは、最近、実行可能な代替手段として現れている。
弱い教師付きアプローチでは、各タイルに割り当てられた注意スコアに基づいて、WSIの全体分類に基づいて、イメージサブセクションまたはタイルを入力として使用することが多い。
しかし、腫瘍は異種であり、がんや正常な細胞は単一のタイルよりも大きなパターンで成長するため、偽陽性/陰性の可能性を見落としている。
このようなタイルレベルのエラーは腫瘍レベルでの誤分類につながる可能性がある。
この限界に対処するため,我々はCHARM(Contrastive Histopathology Attention Resolved Models)と呼ばれる新しい深層学習プール演算子を開発した。
CHARMはWSI内の単一のタイル間の依存関係を活用し、複数のインスタンス学習モデルに対する事前知識としてコンテキスト制約を課します。
我々は,非小細胞肺癌(NSLC)およびリンパ節転移(LN)の亜型化についてCHARMを試験し,他の最先端の弱教師付き分類アルゴリズムよりも優位性を示した。
さらに、CHARMは注意領域を可視化することで解釈しやすくする。
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