論文の概要: Localization of Ultra-dense Emitters with Neural Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.05542v1
- Date: Sun, 7 May 2023 19:20:42 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-10 12:22:35.072267
- Title: Localization of Ultra-dense Emitters with Neural Networks
- Title(参考訳): ニューラルネットワークを用いた超高密度エミッタの局所化
- Authors: Armin Abdehkakha and Craig Snoeyink
- Abstract要約: 本稿では,独立したエミッタ仮定を拒否するユニークなアーキテクチャを用いたLUENNというディープ畳み込みニューラルネットワークを提案する。
完全に孤立しているものから、同じ位置にあるものまで、放射体を円滑に収容することができる。
このアーキテクチャは、正確な位置不確かさを推定すると共に、使用可能なエミッタ密度の範囲を、マイクロメートルあたり6から31エミッタまで拡大し、局所化精度へのペナルティを低減し、時間分解能を改善した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Single-Molecule Localization Microscopy (SMLM) has expanded our ability to
visualize subcellular structures but is limited in its temporal resolution.
Increasing emitter density will improve temporal resolution, but current
analysis algorithms struggle as emitter images significantly overlap. Here we
present a deep convolutional neural network called LUENN which utilizes a
unique architecture that rejects the isolated emitter assumption; it can
smoothly accommodate emitters that range from completely isolated to
co-located. This architecture, alongside an accurate estimator of location
uncertainty, extends the range of usable emitter densities by a factor of 6 to
over 31 emitters per micrometer-squared with reduced penalty to localization
precision and improved temporal resolution. Apart from providing uncertainty
estimation, the algorithm improves usability in laboratories by reducing
imaging times and easing requirements for successful experiments.
- Abstract(参考訳): 単一分子局在顕微鏡(SMLM)は細胞構造を可視化する能力を拡大したが、時間分解能は制限されている。
エミッタ密度の増大は時間分解能を向上させるが、現在の解析アルゴリズムはエミッタ画像が著しく重なるにつれて困難である。
ここでは,分離したエミッタ仮定を拒絶するユニークなアーキテクチャを使用するluennと呼ばれる深い畳み込みニューラルネットワークを提案する。
このアーキテクチャは、正確な位置不確かさを推定すると共に、使用可能なエミッタ密度の範囲を6から31マイクロメートルあたりのエミッタまで拡大し、局所化精度の低下と時間分解能の向上を図っている。
不確実性推定の他に、このアルゴリズムは、撮像時間を短縮し、実験成功の要求を緩和することにより、研究室のユーザビリティを向上させる。
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