論文の概要: Generating high-quality 3DMPCs by adaptive data acquisition and
NeREF-based reflectance correction to facilitate efficient plant phenotyping
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.06777v1
- Date: Thu, 11 May 2023 12:59:21 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-12 14:51:14.254083
- Title: Generating high-quality 3DMPCs by adaptive data acquisition and
NeREF-based reflectance correction to facilitate efficient plant phenotyping
- Title(参考訳): 適応データ取得による高品質3DMPCの生成とNeREFに基づく反射率補正による植物表現の効率化
- Authors: Pengyao Xie, Zhihong Ma, Ruiming Du, Mengqi Lv, Yutao Shen, Xuqi Lu,
Jiangpeng Zhu, Haiyan Cen
- Abstract要約: 高品質な3Dおよびマルチスペクトルデータを用いた植物形質特性の非破壊評価は、育種者の植物成長に対する理解を深める可能性がある。
自然光条件下での主観的視点選択と複雑な照明効果は、データ品質を低下させる。
適応データ取得法と反射率補正法をそれぞれ提案し,高品質な3次元マルチスペクトル点雲を生成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Non-destructive assessments of plant phenotypic traits using high-quality
three-dimensional (3D) and multispectral data can deepen breeders'
understanding of plant growth and allow them to make informed managerial
decisions. However, subjective viewpoint selection and complex illumination
effects under natural light conditions decrease the data quality and increase
the difficulty of resolving phenotypic parameters. We proposed methods for
adaptive data acquisition and reflectance correction respectively, to generate
high-quality 3D multispectral point clouds (3DMPCs) of plants. In the first
stage, we proposed an efficient next-best-view (NBV) planning method based on a
novel UGV platform with a multi-sensor-equipped robotic arm. In the second
stage, we eliminated the illumination effects by using the neural reference
field (NeREF) to predict the digital number (DN) of the reference. We tested
them on 6 perilla and 6 tomato plants, and selected 2 visible leaves and 4
regions of interest (ROIs) for each plant to assess the biomass and the
chlorophyll content. For NBV planning, the average execution time for single
perilla and tomato plant at a joint speed of 1.55 rad/s was 58.70 s and 53.60 s
respectively. The whole-plant data integrity was improved by an average of 27%
compared to using fixed viewpoints alone, and the coefficients of determination
(R2) for leaf biomass estimation reached 0.99 and 0.92. For reflectance
correction, the average root mean squared error of the reflectance spectra with
hemisphere reference-based correction at different ROIs was 0.08 and 0.07 for
perilla and tomato. The R2 of chlorophyll content estimation was 0.91 and 0.93
respectively when principal component analysis and Gaussian process regression
were applied. Our approach is promising for generating high-quality 3DMPCs of
plants under natural light conditions and facilitates accurate plant
phenotyping.
- Abstract(参考訳): 高品質な3次元3次元データとマルチスペクトルデータを用いた植物形質特性の非破壊評価は、育種者の植物成長に対する理解を深め、情報的管理決定を可能にする。
しかし,自然光条件下での主観的視点選択と複雑な照明効果により,データ品質が低下し,表現型パラメータの解消が困難になる。
本研究では,高画質の3次元マルチスペクトル点雲(DMPC)を生成するための適応データ取得法と反射率補正法を提案する。
第1段階では,マルチセンサ搭載ロボットアームを用いた新しいUGVプラットフォームに基づく,効率的な次世代ビュー(NBV)計画手法を提案した。
第2段階では,ニューラル基準場(NeREF)を用いて参照のディジタル数(DN)を予測することにより照明効果を除去した。
植物6種とトマト6種で試験を行い,各植物に可視葉2種と関心領域4種(rois)を選抜し,バイオマスおよびクロロフィル含量を測定した。
NBV計画では, 単根とトマトの1.55 rad/sでの平均実行時間は58.70 sと53.60 sであった。
プラント全体のデータ完全性は, 固定視点のみを用いた場合と比較して平均27%向上し, 葉バイオマスの推定係数 (r2) は0.99, 0.92であった。
反射率補正では,半球基準に基づく異なるroisでの反射率スペクトルの平均根平均二乗誤差は0.08,0.07であった。
クロロフィル含量推定のR2は主成分分析とガウス過程回帰を適用した場合それぞれ0.91と0.93であった。
本手法は, 自然光条件下での高品質な3DMPCの生成と, 植物表現の精度向上に有効である。
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