論文の概要: The Impact of Missing Data on Causal Discovery: A Multicentric Clinical
Study
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.10050v2
- Date: Fri, 3 Nov 2023 14:37:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-06 18:07:18.797544
- Title: The Impact of Missing Data on Causal Discovery: A Multicentric Clinical
Study
- Title(参考訳): 欠失データが因果関係発見に及ぼす影響--多中心性臨床研究
- Authors: Alessio Zanga, Alice Bernasconi, Peter J.F. Lucas, Hanny Pijnenborg,
Casper Reijnen, Marco Scutari, Fabio Stella
- Abstract要約: 子宮内膜癌に対する多施設共同研究から得られたデータを用いて,検索した因果グラフに異なる欠損機構が与える影響を解析した。
専門医による回復グラフの検証を行い,本手法が臨床関連ソリューションを見いだすことを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.173358409934101
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Causal inference for testing clinical hypotheses from observational data
presents many difficulties because the underlying data-generating model and the
associated causal graph are not usually available. Furthermore, observational
data may contain missing values, which impact the recovery of the causal graph
by causal discovery algorithms: a crucial issue often ignored in clinical
studies. In this work, we use data from a multi-centric study on endometrial
cancer to analyze the impact of different missingness mechanisms on the
recovered causal graph. This is achieved by extending state-of-the-art causal
discovery algorithms to exploit expert knowledge without sacrificing
theoretical soundness. We validate the recovered graph with expert physicians,
showing that our approach finds clinically-relevant solutions. Finally, we
discuss the goodness of fit of our graph and its consistency from a clinical
decision-making perspective using graphical separation to validate causal
pathways.
- Abstract(参考訳): 観察データから臨床仮説をテストする因果推論は、基礎となるデータ生成モデルと関連する因果グラフが一般に利用できないため、多くの困難をもたらす。
さらに、観察データには欠落した値が含まれ、因果発見アルゴリズムによる因果グラフの回復に影響を与える可能性がある。
本研究では, 子宮内膜癌に対する多施設共同研究から得られたデータを用いて, 回復した因果グラフに対する異なる欠損機構の影響を解析する。
これは、最先端の因果発見アルゴリズムを拡張して、理論的な健全性を犠牲にすることなく専門家の知識を活用することで達成される。
専門医による回復グラフの検証を行い,本手法が臨床関連ソリューションを見いだすことを示す。
最後に,グラフの適合性とその整合性について,画像分離を用いた臨床的意思決定の観点から検討し,因果経路の検証を行った。
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