論文の概要: Merging Deep Learning with Expert Knowledge for Seizure Onset Zone
localization from rs-fMRI in Pediatric Pharmaco Resistant Epilepsy
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.05572v1
- Date: Thu, 8 Jun 2023 22:07:48 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-12 15:27:10.302818
- Title: Merging Deep Learning with Expert Knowledge for Seizure Onset Zone
localization from rs-fMRI in Pediatric Pharmaco Resistant Epilepsy
- Title(参考訳): 小児薬剤耐性てんかんにおける rs-fMRI を用いた深層学習と専門知識の融合
- Authors: Payal Kamboj, Ayan Banerjee, Sandeep K. S. Gupta and Varina L.
Boerwinkle
- Abstract要約: 若年期の清垂発症帯(SOZs)は薬剤耐性てんかん(PRE)の治療に有効である
頭蓋内脳波(iEEG)によるSOZの術前局在は、安全で効果的な電極配置を必要とする。
DeepXSOZは、a)専門家による作業負荷の大幅な削減や、(b)手術チームの専門知識に基づく高感度操作を設定できる、ループ内のICソート技術である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.087237546722617
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Surgical disconnection of Seizure Onset Zones (SOZs) at an early age is an
effective treatment for Pharmaco-Resistant Epilepsy (PRE). Pre-surgical
localization of SOZs with intra-cranial EEG (iEEG) requires safe and effective
depth electrode placement. Resting-state functional Magnetic Resonance Imaging
(rs-fMRI) combined with signal decoupling using independent component (IC)
analysis has shown promising SOZ localization capability that guides iEEG lead
placement. However, SOZ ICs identification requires manual expert sorting of
100s of ICs per patient by the surgical team which limits the reproducibility
and availability of this pre-surgical screening. Automated approaches for SOZ
IC identification using rs-fMRI may use deep learning (DL) that encodes
intricacies of brain networks from scarcely available pediatric data but has
low precision, or shallow learning (SL) expert rule-based inference approaches
that are incapable of encoding the full spectrum of spatial features. This
paper proposes DeepXSOZ that exploits the synergy between DL based spatial
feature and SL based expert knowledge encoding to overcome performance
drawbacks of these strategies applied in isolation. DeepXSOZ is an
expert-in-the-loop IC sorting technique that a) can be configured to either
significantly reduce expert sorting workload or operate with high sensitivity
based on expertise of the surgical team and b) can potentially enable the usage
of rs-fMRI as a low cost outpatient pre-surgical screening tool. Comparison
with state-of-art on 52 children with PRE shows that DeepXSOZ achieves
sensitivity of 89.79%, precision of 93.6% and accuracy of 84.6%, and reduces
sorting effort by 6.7-fold. Knowledge level ablation studies show a pathway
towards maximizing patient outcomes while optimizing the machine-expert
collaboration for various scenarios.
- Abstract(参考訳): 早期の青少年発症帯(SOZs)の外科的解離はPRE(Pharmaco-Resistant Epilepsy)の有効治療である。
頭蓋内脳波(iEEG)によるSOZの術前局在は、安全で効果的な電極配置を必要とする。
静止状態機能型磁気共鳴イメージング (rs-fMRI) と独立成分 (IC) 分析を用いた信号デカップリングを併用すると, iEEG の鉛配置を誘導する SOZ 局在能が期待できることが示された。
しかし、SOZ ICの識別には、手術チームによって患者1人当たり100件のICを手動で分類する必要がある。
rs-fmri を用いた soz ic の自動同定手法では, 小児データから脳ネットワークの複雑さをエンコードする深層学習 (dl) や, 空間的特徴の完全なスペクトルをエンコードできない浅層学習 (sl) の規則に基づく推論手法が用いられる。
本稿では,dlベース空間特徴とslベースエキスパート知識エンコーディングの相乗効果を生かしたdeepxsozを提案する。
DeepXSOZは、ループ内のICソート技術である
a) 専門家による作業負荷のソートを著しく削減するか,あるいは外科チームの専門知識に基づいて高い感度で作業を行うように設定することができる。
b) RS-fMRIを低費用外来スクリーニングツールとして使用できる可能性がある。
Preを持つ52人の子供の最先端技術と比較すると、DeepXSOZの感度は89.79%、精度は93.6%、精度は84.6%、ソート作業は6.7倍である。
知識レベルのアブレーション研究は、様々なシナリオにおいて、マシン-専門家のコラボレーションを最適化しながら、患者結果の最大化への道筋を示す。
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