論文の概要: Robust and Generalisable Segmentation of Subtle Epilepsy-causing
Lesions: a Graph Convolutional Approach
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.01375v2
- Date: Mon, 5 Jun 2023 14:25:53 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-06 11:13:35.251612
- Title: Robust and Generalisable Segmentation of Subtle Epilepsy-causing
Lesions: a Graph Convolutional Approach
- Title(参考訳): 部分てんかん性病変のロバストおよび包括的切除 : グラフ畳み込みアプローチ
- Authors: Hannah Spitzer, Mathilde Ripart, Abdulah Fawaz, Logan Z. J. Williams,
MELD project, Emma Robinson, Juan Eugenio Iglesias, Sophie Adler, Konrad
Wagstyl
- Abstract要約: FCD(Foccal cortical dysplasia)は薬剤抵抗性てんかんの主要な原因であり、手術で治療できる。
そのため、手動の傷口マスクは高価で、限定的であり、ラッター間変動が大きい。
本稿では,グラフ畳み込みネットワーク(GCN)を用いたセマンティックセグメンテーション(セマンティックセグメンテーション,セマンティックセグメンテーション,セマンティックセグメンテーション)の手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.180462901068842
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Focal cortical dysplasia (FCD) is a leading cause of drug-resistant focal
epilepsy, which can be cured by surgery. These lesions are extremely subtle and
often missed even by expert neuroradiologists. "Ground truth" manual lesion
masks are therefore expensive, limited and have large inter-rater variability.
Existing FCD detection methods are limited by high numbers of false positive
predictions, primarily due to vertex- or patch-based approaches that lack
whole-brain context. Here, we propose to approach the problem as semantic
segmentation using graph convolutional networks (GCN), which allows our model
to learn spatial relationships between brain regions. To address the specific
challenges of FCD identification, our proposed model includes an auxiliary loss
to predict distance from the lesion to reduce false positives and a weak
supervision classification loss to facilitate learning from uncertain lesion
masks. On a multi-centre dataset of 1015 participants with surface-based
features and manual lesion masks from structural MRI data, the proposed GCN
achieved an AUC of 0.74, a significant improvement against a previously used
vertex-wise multi-layer perceptron (MLP) classifier (AUC 0.64). With
sensitivity thresholded at 67%, the GCN had a specificity of 71% in comparison
to 49% when using the MLP. This improvement in specificity is vital for
clinical integration of lesion-detection tools into the radiological workflow,
through increasing clinical confidence in the use of AI radiological adjuncts
and reducing the number of areas requiring expert review.
- Abstract(参考訳): focal cortical dysplasia (fcd) は薬剤耐性の焦点てんかんの主要な原因であり、手術によって治療することができる。
これらの病変は極めて微妙であり、専門の神経放射線学者にも見逃されることが多い。
そのため、手動の傷口マスクは高価で、限定的であり、器間変動が大きい。
既存のFCD検出方法は、主に全脳コンテキストを欠いた頂点またはパッチベースのアプローチによって、多数の偽陽性予測によって制限される。
本稿では,脳領域間の空間関係を学習できるグラフ畳み込みネットワーク(gcn)を用いた意味セグメンテーションとしてこの問題にアプローチする。
FCD識別の具体的な課題に対処するため,提案モデルでは,偽陽性を減少させるために病変からの距離を予測する補助的損失と,不確実な病変マスクからの学習を容易にするための監督的分類損失を含む。
構造的mriデータから, 表面的特徴と手動病変を有する1015名からなるマルチセンタデータセットにおいて, 提案するgcnは0.74のaucを達成し, 従来使用されていた多層パーセプトロン (mlp) 分類器 (auc 0.64) に対して有意な改善が得られた。
感度は67%であり, mlp使用時の49%に比べ, gcnの特異度は71%であった。
この特異性の改善は、ai放射線補助薬の使用に対する臨床信頼を高め、専門家レビューを必要とする領域の数を減らすことによって、病変検出ツールの放射線ワークフローへの臨床統合に不可欠である。
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