論文の概要: Semi-supervised Cell Recognition under Point Supervision
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.08240v1
- Date: Wed, 14 Jun 2023 04:56:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-16 20:26:20.463299
- Title: Semi-supervised Cell Recognition under Point Supervision
- Title(参考訳): 点監督下での半教師細胞認識
- Authors: Zhongyi Shui, Yizhi Zhao, Sunyi Zheng, Yunlong Zhang, Honglin Li,
Shichuan Zhang, Xiaoxuan Yu, Chenglu Zhu, Lin Yang
- Abstract要約: ポイントベースの細胞認識(PCR)法は通常、大量のアノテーションを必要とする。
半教師付きポイントベース細胞認識(SSPCR)はほとんど見落とされ続けている。
本稿では,エンド・ツー・エンドのPCRモデルに適したSSPCRフレームワークを初めて開発する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.536526198969589
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Cell recognition is a fundamental task in digital histopathology image
analysis. Point-based cell recognition (PCR) methods normally require a vast
number of annotations, which is extremely costly, time-consuming and
labor-intensive. Semi-supervised learning (SSL) can provide a shortcut to make
full use of cell information in gigapixel whole slide images without exhaustive
labeling. However, research into semi-supervised point-based cell recognition
(SSPCR) remains largely overlooked. Previous SSPCR works are all built on
density map-based PCR models, which suffer from unsatisfactory accuracy, slow
inference speed and high sensitivity to hyper-parameters. To address these
issues, end-to-end PCR models are proposed recently. In this paper, we develop
a SSPCR framework suitable for the end-to-end PCR models for the first time.
Overall, we use the current models to generate pseudo labels for unlabeled
images, which are in turn utilized to supervise the models training. Besides,
we introduce a co-teaching strategy to overcome the confirmation bias problem
that generally exists in self-training. A distribution alignment technique is
also incorporated to produce high-quality, unbiased pseudo labels for unlabeled
data. Experimental results on four histopathology datasets concerning different
types of staining styles show the effectiveness and versatility of the proposed
framework. Code is available at
\textcolor{magenta}{\url{https://github.com/windygooo/SSPCR}
- Abstract(参考訳): 細胞認識はデジタル病理画像解析の基本的な課題である。
ポイントベースの細胞認識(PCR)法は通常、非常にコストがかかり、時間がかかり、労力がかかる大量のアノテーションを必要とする。
semi-supervised learning (ssl) はギガピクセル全体のスライド画像でセル情報をフル活用するためのショートカットを提供する。
しかし、半教師付きポイントベース細胞認識(SSPCR)の研究はほとんど見過ごされている。
従来のsspcrの研究はすべて密度マップベースのpcrモデルに基づいており、精度が不十分で推論速度が遅く、ハイパーパラメータに対する感度が高い。
これらの問題に対処するため,近年,エンドツーエンドpcrモデルが提案されている。
本稿では,エンド・ツー・エンドのPCRモデルに適したSSPCRフレームワークを初めて開発する。
全体としては、現在のモデルを用いてラベルなし画像の擬似ラベルを生成し、モデルトレーニングを監督するために使用される。
さらに,自己学習に一般的に存在する確証バイアス問題を克服するために,共同学習戦略を導入する。
分散アライメント技術も組み込まれ、ラベルなしデータに対して高品質でバイアスのない擬似ラベルを生成する。
各種染色スタイルに関する4つの病理組織学的データセットの実験結果から,提案手法の有効性と妥当性が示された。
コードは \textcolor{magenta}{\url{https://github.com/windygooo/SSPCR} で入手できる。
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