論文の概要: Topology-Aware Loss for Aorta and Great Vessel Segmentation in Computed
Tomography Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.03137v1
- Date: Thu, 6 Jul 2023 17:06:49 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-07 13:06:57.321516
- Title: Topology-Aware Loss for Aorta and Great Vessel Segmentation in Computed
Tomography Images
- Title(参考訳): ct画像における大動脈および大血管分節のトポロジー認識損失
- Authors: Seher Ozcelik, Sinan Unver, Ilke Ali Gurses, Rustu Turkay, and Cigdem
Gunduz-Demir
- Abstract要約: 本稿では, 地平と予測のトポロジの相違を罰する新たなトポロジ認識損失関数を提案する。
4327枚のCT画像から,提案したトポロジ・アウェア・ロス関数がそれより優れた結果をもたらすことが明らかとなった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.218316486552747
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Segmentation networks are not explicitly imposed to learn global invariants
of an image, such as the shape of an object and the geometry between multiple
objects, when they are trained with a standard loss function. On the other
hand, incorporating such invariants into network training may help improve
performance for various segmentation tasks when they are the intrinsic
characteristics of the objects to be segmented. One example is segmentation of
aorta and great vessels in computed tomography (CT) images where vessels are
found in a particular geometry in the body due to the human anatomy and they
mostly seem as round objects on a 2D CT image. This paper addresses this issue
by introducing a new topology-aware loss function that penalizes topology
dissimilarities between the ground truth and prediction through persistent
homology. Different from the previously suggested segmentation network designs,
which apply the threshold filtration on a likelihood function of the prediction
map and the Betti numbers of the ground truth, this paper proposes to apply the
Vietoris-Rips filtration to obtain persistence diagrams of both ground truth
and prediction maps and calculate the dissimilarity with the Wasserstein
distance between the corresponding persistence diagrams. The use of this
filtration has advantage of modeling shape and geometry at the same time, which
may not happen when the threshold filtration is applied. Our experiments on
4327 CT images of 24 subjects reveal that the proposed topology-aware loss
function leads to better results than its counterparts, indicating the
effectiveness of this use.
- Abstract(参考訳): セグメンテーションネットワークは、標準的な損失関数で訓練された場合、オブジェクトの形状や複数のオブジェクト間の幾何など、画像のグローバル不変性を学ぶために明示的に強制されない。
一方,このような不変性をネットワークトレーニングに組み込むことで,分割対象の固有特性である様々なセグメンテーションタスクの性能を向上させることができる。
例えば、CT画像における大動脈と大血管の分節化では、人間の解剖学により体内の特定の形状に血管が見出され、2次元CT画像上の丸い物体のように見える。
本稿では, 基底的真理と持続的ホモロジーによる予測とのトポロジの相違を罰する新たなトポロジ認識損失関数を導入することにより, この問題に対処する。
予測写像の確率関数と基底真理のベッチ数にしきい値濾過を適用した従来提案されていた分節ネットワーク設計とは違って, ヴィトリス・リップス濾過を適用し, 基底真理と予測写像の持続性図を取得し, 対応する持続性図間のワッサースタイン距離との差を計算することを提案する。
この濾過を用いると、形状と形状を同時にモデル化する利点があるが、しきい値濾過が適用されるとは起こり得ない。
24名の被験者の4327ct画像を用いた実験により,提案するトポロジー認識損失関数が,提案手法よりも優れた結果をもたらすことが明らかとなった。
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