論文の概要: A Deep Learning Approach for Overall Survival Prediction in Lung Cancer
with Missing Values
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.11465v3
- Date: Fri, 28 Jul 2023 10:20:13 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-31 15:11:13.464705
- Title: A Deep Learning Approach for Overall Survival Prediction in Lung Cancer
with Missing Values
- Title(参考訳): 予後不良肺癌の総合的生存予測のための深層学習アプローチ
- Authors: Camillo Maria Caruso, Valerio Guarrasi, Sara Ramella and Paolo Soda
- Abstract要約: 総合生存率(OS)は、患者の状態を示す重要な指標であり、適切な治療とOS率の向上を可能にする。
我々は,NSCLCの文脈において,欠落した値を用いた生存分析の新しい手法を提案する。
OSのアドホックな損失を利用することで、検閲された患者と無検閲の患者の両方、そして時間の経過とともにリスクの変化を説明できる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.3821435467741148
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: One of the most challenging fields where Artificial Intelligence (AI) can be
applied is lung cancer research, specifically non-small cell lung cancer
(NSCLC). In particular, overall survival (OS), the time between diagnosis and
death, is a vital indicator of patient status, enabling tailored treatment and
improved OS rates. In this analysis, there are two challenges to take into
account. First, few studies effectively exploit the information available from
each patient, leveraging both uncensored (i.e., dead) and censored (i.e.,
survivors) patients, considering also the events' time. Second, the handling of
incomplete data is a common issue in the medical field. This problem is
typically tackled through the use of imputation methods. Our objective is to
present an AI model able to overcome these limits, effectively learning from
both censored and uncensored patients and their available features, for the
prediction of OS for NSCLC patients. We present a novel approach to survival
analysis with missing values in the context of NSCLC, which exploits the
strengths of the transformer architecture to account only for available
features without requiring any imputation strategy. By making use of ad-hoc
losses for OS, it is able to account for both censored and uncensored patients,
as well as changes in risks over time. We compared our method with
state-of-the-art models for survival analysis coupled with different imputation
strategies. We evaluated the results obtained over a period of 6 years using
different time granularities obtaining a Ct-index, a time-dependent variant of
the C-index, of 71.97, 77.58 and 80.72 for time units of 1 month, 1 year and 2
years, respectively, outperforming all state-of-the-art methods regardless of
the imputation method used.
- Abstract(参考訳): 人工知能(AI)が適用可能な最も困難な分野の1つは、肺癌の研究、特に非小細胞肺癌(NSCLC)である。
特に、診断から死亡までの生存期間(OS)は、患者の状態を示す重要な指標であり、適切な治療とOS率の向上を可能にしている。
この分析では、考慮すべき課題が2つあります。
第一に、各患者から得られる情報を効果的に活用する研究はほとんどなく、イベントの時間も考慮し、無検閲(死)と検閲(生存者)の両方を利用する。
第二に、医療分野では不完全なデータの取り扱いが一般的な問題である。
この問題は、通常、インプテーション法を用いて取り組まれる。
本研究の目的は,NSCLC患者に対するOSの予測のために,検閲および非検閲患者の双方から効果的に学習し,これらの限界を克服できるAIモデルを提供することである。
そこで本研究では,nsclcの文脈において,インプット戦略を必要とせずに利用可能な特徴のみを考慮し,トランスフォーマーアーキテクチャの強みを生かしたサバイバル解析手法を提案する。
OSのアドホックな損失を利用することで、検閲された患者と無検閲の患者の両方、そして時間の経過とともにリスクの変化を説明できる。
本手法を生存分析のための最新モデルと比較し, 異なるインプテーション戦略を併用した。
C-インデックスの時間依存性変種であるCt-index(71.97, 77.58, 80.72)を1ヶ月, 1年, 2年の時間単位で取得し, 計算方法によらず, C-indexの時間依存性の異なるCt-index(71.97, 77.58, 80.72)を経年的に評価した。
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