論文の概要: Causal thinking for decision making on Electronic Health Records: why
and how
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.01605v2
- Date: Wed, 6 Sep 2023 08:41:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-09-07 18:39:38.192760
- Title: Causal thinking for decision making on Electronic Health Records: why
and how
- Title(参考訳): 電子健康記録における意思決定のための因果思考--理由と方法
- Authors: Matthieu Doutreligne (SODA), Tristan Struja (MIT, USZ), Judith
Abecassis (SODA), Claire Morgand (ARS IDF), Leo Anthony Celi (MIT), Ga\"el
Varoquaux (SODA)
- Abstract要約: データ駆動決定には因果思考が必要である。
実生活の患者記録から有効な意思決定を支援するための,ステップバイステップのフレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate predictions, as with machine learning, may not suffice to provide
optimal healthcare for every patient. Indeed, prediction can be driven by
shortcuts in the data, such as racial biases. Causal thinking is needed for
data-driven decisions. Here, we give an introduction to the key elements,
focusing on routinely-collected data, electronic health records (EHRs) and
claims data. Using such data to assess the value of an intervention requires
care: temporal dependencies and existing practices easily confound the causal
effect. We present a step-by-step framework to help build valid decision making
from real-life patient records by emulating a randomized trial before
individualizing decisions, eg with machine learning. Our framework highlights
the most important pitfalls and considerations in analysing EHRs or claims data
to draw causal conclusions. We illustrate the various choices in studying the
effect of albumin on sepsis mortality in the Medical Information Mart for
Intensive Care database (MIMIC-IV). We study the impact of various choices at
every step, from feature extraction to causal-estimator selection. In a
tutorial spirit, the code and the data are openly available.
- Abstract(参考訳): 正確な予測は、機械学習と同様に、すべての患者に最適な医療を提供するのに十分ではないかもしれない。
実際、予測はデータのショートカット(例えば人種バイアス)によって駆動される。
データ駆動決定には因果思考が必要である。
ここでは、日常的に収集されるデータ、電子健康記録(ehrs)、クレームデータを中心に、重要な要素について紹介する。
このようなデータを使用して介入の価値を評価するには、注意が必要です。
ランダム化試行をエミュレートして実生活の患者記録から有効な意思決定を行うためのステップ・バイ・ステップのフレームワークを提案する。
我々のフレームワークは、因果的な結論を引き出すために、EHRやクレームデータを分析する上で最も重要な落とし穴と考察を強調します。
集中治療データベース(MIMIC-IV)において,アルブミンが敗血症死亡率に及ぼす影響について検討した。
特徴抽出から因果推定選択まで,各ステップにおける多様な選択の影響について検討した。
チュートリアルの精神では、コードとデータは公開されています。
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