論文の概要: CartiMorph: a framework for automated knee articular cartilage
morphometrics
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.01981v1
- Date: Thu, 3 Aug 2023 18:28:50 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-07 14:51:19.493495
- Title: CartiMorph: a framework for automated knee articular cartilage
morphometrics
- Title(参考訳): CartiMorph:人工膝関節軟骨形態計測のためのフレームワーク
- Authors: Yongcheng Yao, Junru Zhong, Liping Zhang, Sheheryar Khan, Weitian Chen
- Abstract要約: CartiMorphは人工膝関節軟骨形態計測のためのフレームワークである。
軟骨下領域(FCL)、平均厚さ、表面積、体積の比率など)の指標を生成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.2572127128312016
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: We introduce CartiMorph, a framework for automated knee articular cartilage
morphometrics. It takes an image as input and generates quantitative metrics
for cartilage subregions, including the percentage of full-thickness cartilage
loss (FCL), mean thickness, surface area, and volume. CartiMorph leverages the
power of deep learning models for hierarchical image feature representation.
Deep learning models were trained and validated for tissue segmentation,
template construction, and template-to-image registration. We established
methods for surface-normal-based cartilage thickness mapping, FCL estimation,
and rule-based cartilage parcellation. Our cartilage thickness map showed less
error in thin and peripheral regions. We evaluated the effectiveness of the
adopted segmentation model by comparing the quantitative metrics obtained from
model segmentation and those from manual segmentation. The root-mean-squared
deviation of the FCL measurements was less than 8%, and strong correlations
were observed for the mean thickness (Pearson's correlation coefficient $\rho
\in [0.82,0.97]$), surface area ($\rho \in [0.82,0.98]$) and volume ($\rho \in
[0.89,0.98]$) measurements. We compared our FCL measurements with those from a
previous study and found that our measurements deviated less from the ground
truths. We observed superior performance of the proposed rule-based cartilage
parcellation method compared with the atlas-based approach. CartiMorph has the
potential to promote imaging biomarkers discovery for knee osteoarthritis.
- Abstract(参考訳): 人工膝関節軟骨形態計測の枠組みであるCartiMorphを紹介した。
入力として画像を取得し、フル厚さ軟骨損失(FCL)、平均厚さ、表面積、体積の比率を含む軟骨サブリージョンの定量値を生成する。
CartiMorphは階層的な画像特徴表現にディープラーニングモデルのパワーを利用する。
深層学習モデルは、組織セグメンテーション、テンプレート構築、テンプレート・ツー・イメージ登録のために訓練され、検証された。
表面正規化軟骨厚マッピング, FCL推定, およびルールベース軟骨粒度解析の手法を確立した。
軟骨厚図では, 薄い領域と周辺領域では誤差が低かった。
モデルセグメンテーションから得られた量と手動セグメンテーションから得られた量を比較することで,採用セグメンテーションモデルの有効性を評価した。
FCL測定の根平均二乗偏差は8%未満であり, 平均厚さ (Pearson's correlation coefficient $\rho \in [0.82,0.97]$), 表面積$\rho \in [0.82,0.98]$), 体積$\rho \in [0.89,0.98]$) に対して強い相関関係が認められた。
我々は、FCLの測定を以前の研究と比較し、我々の測定が真実から逸脱することを発見した。
本研究は,アトラス法と比較して,ルールベース軟骨解析法の優れた性能を示した。
CartiMorphは、膝関節症に対する画像バイオマーカーの発見を促進する可能性がある。
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