論文の概要: Can ultrasound confidence maps predict sonographers' labeling
variability?
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.09433v1
- Date: Fri, 18 Aug 2023 10:07:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-21 13:35:20.832195
- Title: Can ultrasound confidence maps predict sonographers' labeling
variability?
- Title(参考訳): 超音波信頼度マップは超音波撮影者のラベリング変動を予測できるか?
- Authors: Vanessa Gonzalez Duque, Leonhard Zirus, Yordanka Velikova, Nassir
Navab, and Diana Mateus
- Abstract要約: 本研究は,ソノグラフィーの不確実性を考慮するために,超音波セグメンテーションネットワークを誘導する新しい手法を提案する。
信頼性マップの低値と専門家のラベルの不確実性との間には相関関係があることが示されている。
以上の結果から,超音波CMではDiceスコアが増加し,HusdorffおよびAverage Surface Distanceが向上し,孤立画素の予測回数が減少した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 38.75943978900532
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Measuring cross-sectional areas in ultrasound images is a standard tool to
evaluate disease progress or treatment response. Often addressed today with
supervised deep-learning segmentation approaches, existing solutions highly
depend upon the quality of experts' annotations. However, the annotation
quality in ultrasound is anisotropic and position-variant due to the inherent
physical imaging principles, including attenuation, shadows, and missing
boundaries, commonly exacerbated with depth. This work proposes a novel
approach that guides ultrasound segmentation networks to account for
sonographers' uncertainties and generate predictions with variability similar
to the experts. We claim that realistic variability can reduce overconfident
predictions and improve physicians' acceptance of deep-learning cross-sectional
segmentation solutions. Our method provides CM's certainty for each pixel for
minimal computational overhead as it can be precalculated directly from the
image. We show that there is a correlation between low values in the confidence
maps and expert's label uncertainty. Therefore, we propose to give the
confidence maps as additional information to the networks. We study the effect
of the proposed use of ultrasound CMs in combination with four state-of-the-art
neural networks and in two configurations: as a second input channel and as
part of the loss. We evaluate our method on 3D ultrasound datasets of the
thyroid and lower limb muscles. Our results show ultrasound CMs increase the
Dice score, improve the Hausdorff and Average Surface Distances, and decrease
the number of isolated pixel predictions. Furthermore, our findings suggest
that ultrasound CMs improve the penalization of uncertain areas in the ground
truth data, thereby improving problematic interpolations. Our code and example
data will be made public at
https://github.com/IFL-CAMP/Confidence-segmentation.
- Abstract(参考訳): 超音波画像における断面積の測定は、疾患の進行や治療反応を評価するための標準ツールである。
多くの場合、教師付きディープラーニングセグメンテーションアプローチで対処されるが、既存のソリューションは専門家のアノテーションの品質に大きく依存する。
しかし、超音波のアノテーションの品質は、減衰、影、境界の欠如など固有の物理画像原理により異方性と位置変化があり、一般的には深さが増す。
本研究は, 超音波セグメンテーションネットワークを誘導し, ソノグラフィーの不確かさを考慮し, 専門家に類似した変動性のある予測を生成する手法を提案する。
現実的な変動は、過信予測を減らし、深層学習断面積解の医師の受容を改善することができると主張している。
本手法は,画像から直接計算できるため,計算オーバーヘッドを最小限に抑えるため,各画素に対してcmの確実性を提供する。
信頼度マップの低値と専門家のラベルの不確実性との間に相関があることを示す。
そこで本稿では,ネットワークに付加的な情報として信頼性マップを提案する。
提案した超音波CMと4つの最先端ニューラルネットワークの組み合わせによる2つの構成(第2入力チャネルと損失の一部)の効果について検討した。
甲状腺および下肢筋の3次元超音波データを用いた検討を行った。
以上の結果から,超音波CMではDiceスコアが増加し,HusdorffおよびAverage Surface Distanceが向上し,孤立画素の予測回数が減少した。
さらに, 超音波CMは, 真理データ中の不確定領域のペナル化を改善し, 補間問題を改善することが示唆された。
私たちのコードとサンプルデータはhttps://github.com/ifl-camp/confidence-segmentationで公開されます。
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