論文の概要: Trustworthy Medical Segmentation with Uncertainty Estimation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2111.05978v1
- Date: Wed, 10 Nov 2021 22:46:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-11-13 01:56:24.040718
- Title: Trustworthy Medical Segmentation with Uncertainty Estimation
- Title(参考訳): 不確実性推定による信頼できる医用セグメンテーション
- Authors: Giuseppina Carannante, Dimah Dera, Nidhal C.Bouaynaya, Rasool Ghulam,
and Hassan M. Fathallah-Shaykh
- Abstract要約: 本稿では,セグメンテーションニューラルネットワークにおける不確実性定量化のための新しいベイズディープラーニングフレームワークを提案する。
我々は磁気共鳴イメージングとCTによる医用画像分割データについて検討した。
複数のベンチマークデータセットに対する実験により,提案するフレームワークは,最先端セグメンテーションモデルと比較して,ノイズや敵攻撃に対してより堅牢であることが示された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.7829352305480285
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Deep Learning (DL) holds great promise in reshaping the healthcare systems
given its precision, efficiency, and objectivity. However, the brittleness of
DL models to noisy and out-of-distribution inputs is ailing their deployment in
the clinic. Most systems produce point estimates without further information
about model uncertainty or confidence. This paper introduces a new Bayesian
deep learning framework for uncertainty quantification in segmentation neural
networks, specifically encoder-decoder architectures. The proposed framework
uses the first-order Taylor series approximation to propagate and learn the
first two moments (mean and covariance) of the distribution of the model
parameters given the training data by maximizing the evidence lower bound. The
output consists of two maps: the segmented image and the uncertainty map of the
segmentation. The uncertainty in the segmentation decisions is captured by the
covariance matrix of the predictive distribution. We evaluate the proposed
framework on medical image segmentation data from Magnetic Resonances Imaging
and Computed Tomography scans. Our experiments on multiple benchmark datasets
demonstrate that the proposed framework is more robust to noise and adversarial
attacks as compared to state-of-the-art segmentation models. Moreover, the
uncertainty map of the proposed framework associates low confidence (or
equivalently high uncertainty) to patches in the test input images that are
corrupted with noise, artifacts or adversarial attacks. Thus, the model can
self-assess its segmentation decisions when it makes an erroneous prediction or
misses part of the segmentation structures, e.g., tumor, by presenting higher
values in the uncertainty map.
- Abstract(参考訳): 深層学習(DL)は、正確さ、効率、客観性を考慮し、医療システムを再構築する上で大きな可能性を秘めている。
しかし, DLモデルのノイズやアウト・オブ・ディストリビューション入力に対する脆さは, 診療所への展開を妨げている。
ほとんどのシステムは、モデルの不確実性や信頼性に関するさらなる情報なしで点推定を生成する。
本稿では,セグメンテーションニューラルネットワーク,特にエンコーダ・デコーダアーキテクチャにおける不確実性定量化のための新しいベイズディープラーニングフレームワークを提案する。
提案フレームワークはテイラー級数近似を用いて、トレーニングデータから得られたモデルパラメータの分布の最初の2つのモーメント(平均と共分散)を伝播し学習する。
出力はセグメンテーションの画像とセグメンテーションの不確実性マップの2つのマップで構成される。
セグメンテーション決定の不確実性は予測分布の共分散行列によって把握される。
磁気共鳴画像とctスキャンから得られた医用画像分割データの枠組みについて検討した。
複数のベンチマークデータセットに対する実験により,提案手法は,最先端セグメンテーションモデルと比較して,ノイズや敵攻撃に対してより堅牢であることが示された。
さらに,提案フレームワークの不確実性マップは,ノイズやアーティファクト,敵の攻撃で破損したテスト入力画像のパッチと低信頼(あるいは同等に高い不確実性)を関連付ける。
これにより、不確実性マップに高い値を示すことによって、誤った予測を行う場合や、腫瘍などのセグメンテーション構造の一部を見逃す場合に、そのセグメンテーション決定を自己評価することができる。
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