論文の概要: CRC-ICM: Colorectal Cancer Immune Cell Markers Pattern Dataset
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.10033v1
- Date: Sat, 19 Aug 2023 14:39:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-22 18:17:56.816966
- Title: CRC-ICM: Colorectal Cancer Immune Cell Markers Pattern Dataset
- Title（参考訳）: CRC-ICM: 大腸癌免疫細胞マーカーパターンデータセット
- Authors: Zahra Mokhtari, Elham Amjadi, Hamidreza Bolhasani, Zahra Faghih,
AmirReza Dehghanian, Marzieh Rezaei
- Abstract要約: 大腸癌は世界で2番目に多い死因である。
CRCは染色体, 分子特性, 微生物発生, 病因, 結果の相違を示した。
このデータセットの名前はCRC-ICMで、136人の患者に関連する1756の画像を含んでいる。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.18641315013048293
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Colorectal Cancer (CRC) is the second most common cause of cancer death in
the world, ad can be identified by the location of the primary tumor in the
large intestine: right and left colon, and rectum. Based on the location, CRC
shows differences in chromosomal and molecular characteristics, microbiomes
incidence, pathogenesis, and outcome. It has been shown that tumors on left and
right sides also have different immune landscape, so the prognosis may be
different based on the primary tumor locations. It is widely accepted that
immune components of the tumor microenvironment (TME) plays a critical role in
tumor development. One of the critical regulatory molecules in the TME is
immune checkpoints that as the gatekeepers of immune responses regulate the
infiltrated immune cell functions. Inhibitory immune checkpoints such as PD-1,
Tim3, and LAG3, as the main mechanism of immune suppression in TME
overexpressed and result in further development of the tumor. The images of
this dataset have been taken from colon tissues of patients with CRC, stained
with specific antibodies for CD3, CD8, CD45RO, PD-1, LAG3 and Tim3. The name of
this dataset is CRC-ICM and contains 1756 images related to 136 patients. The
initial version of CRC-ICM is published on Elsevier Mendeley dataset portal,
and the latest version is accessible via: https://databiox.com
- Abstract（参考訳）: 大腸癌は世界で2番目に多いがん死の原因であり、adは大腸の原発性腫瘍(左右結腸、直腸)の位置によって同定できる。
この位置に基づいて、CRCは染色体および分子特性、微生物の発生率、病因、および結果の相違を示す。
左右の腫瘍も免疫組織学的に異なっており,原発巣により予後が異なる可能性が指摘されている。
腫瘍微小環境(TME)の免疫成分が腫瘍発生に重要な役割を果たすことは広く受け入れられている。
tmeにおける重要な調節分子の1つは、免疫応答のゲートキーパーが浸潤した免疫細胞機能を調節する免疫チェックポイントである。
TMEの免疫抑制機構としてPD-1、Tim3、RAG3などの免疫チェックポイントが過剰発現し、腫瘍のさらなる進展をもたらす。
このデータセットの画像は、CD3, CD8, CD45RO, PD-1, LAG3, Tim3の特定の抗体で染色されたCRC患者の大腸組織から得られた。
このデータセットの名前はCRC-ICMで、136人の患者に関連する1756の画像を含んでいる。
crc-icmの初期バージョンは elsevier mendeley dataset portal で公開されており、最新バージョンは https://databiox.com でアクセス可能である。
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