論文の概要: Explainable Graph Neural Network for Alzheimer's Disease And Related
Dementias Risk Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.06584v1
- Date: Tue, 12 Sep 2023 20:12:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-09-14 16:22:03.399999
- Title: Explainable Graph Neural Network for Alzheimer's Disease And Related
Dementias Risk Prediction
- Title(参考訳): アルツハイマー病に対する説明可能なグラフニューラルネットワークと認知症リスク予測
- Authors: Xinyue Hu (1), Zenan Sun (1), Yi Nian (1), Yifang Dang (1), Fang Li
(1), Jingna Feng (1), Evan Yu (1), Cui Tao (1) ((1) McWilliams School of
Biomedical Informatics, The University of Texas Health Science Center at
Houston, Houston, TX, USA)
- Abstract要約: アルツハイマー病と認知症(ADRD)は米国で6番目に多い死因である。
我々の目標は、ADRDリスク予測のためのクレームデータとグラフネットワーク(GNN)を使用することです。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Alzheimer's disease and related dementias (ADRD) ranks as the sixth leading
cause of death in the US, underlining the importance of accurate ADRD risk
prediction. While recent advancement in ADRD risk prediction have primarily
relied on imaging analysis, yet not all patients undergo medical imaging before
an ADRD diagnosis. Merging machine learning with claims data can reveal
additional risk factors and uncover interconnections among diverse medical
codes. Our goal is to utilize Graph Neural Networks (GNNs) with claims data for
ADRD risk prediction. Addressing the lack of human-interpretable reasons behind
these predictions, we introduce an innovative method to evaluate relationship
importance and its influence on ADRD risk prediction, ensuring comprehensive
interpretation.
We employed Variationally Regularized Encoder-decoder Graph Neural Network
(VGNN) for estimating ADRD likelihood. We created three scenarios to assess the
model's efficiency, using Random Forest and Light Gradient Boost Machine as
baselines. We further used our relation importance method to clarify the key
relationships for ADRD risk prediction. VGNN surpassed other baseline models by
10% in the area under the receiver operating characteristic. The integration of
the GNN model and relation importance interpretation could potentially play an
essential role in providing valuable insight into factors that may contribute
to or delay ADRD progression.
Employing a GNN approach with claims data enhances ADRD risk prediction and
provides insights into the impact of interconnected medical code relationships.
This methodology not only enables ADRD risk modeling but also shows potential
for other image analysis predictions using claims data.
- Abstract(参考訳): アルツハイマー病と関連する認知症(ADRD)は、ADRDの正確なリスク予測の重要性を浮き彫りにして、米国で6番目に大きな死因となっている。
近年のADRDリスク予測の進歩は画像解析に大きく依存しているが,ADRD診断に先立ってすべての患者が画像診断を受けているわけではない。
機械学習とクレームデータの融合は、さまざまな医療コード間の新たなリスク要因や相互関係を明らかにする可能性がある。
我々の目標は、ADRDリスク予測のためのクレームデータとグラフニューラルネットワーク(GNN)を使用することです。
これらの予測の背後にある人間解釈可能な理由の欠如に対処し,関係の重要性とそのadrdリスク予測への影響を評価し,包括的解釈を確実にする革新的な手法を提案する。
我々はADRD確率を推定するために変分正規化エンコーダデコーダグラフニューラルネットワーク(VGNN)を用いた。
モデル効率を評価するために,ランダムフォレストと光勾配ブーストマシンをベースラインとして用いた3つのシナリオを作成した。
我々はさらに,ADRDリスク予測の鍵となる関係を明らかにするために,関係重要度法を適用した。
vgnnは、受信機の動作特性の下で、他のベースラインモデルを10%上回った。
gnnモデルと関係重要度解釈の統合は、adrdの進行に寄与または遅延する要因に対する貴重な洞察を提供する上で重要な役割を果たす可能性がある。
クレームデータによるGNNアプローチの採用はADRDリスク予測を強化し、相互接続された医療コード関係の影響に関する洞察を提供する。
この手法はADRDリスクモデリングを可能にするだけでなく、クレームデータを用いた他の画像解析予測の可能性を示す。
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