論文の概要: Self-Supervised Neuron Segmentation with Multi-Agent Reinforcement
Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.04148v1
- Date: Fri, 6 Oct 2023 10:40:46 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-09 18:50:41.871108
- Title: Self-Supervised Neuron Segmentation with Multi-Agent Reinforcement
Learning
- Title(参考訳): マルチエージェント強化学習による自己監督型ニューロン分割
- Authors: Yinda Chen, Wei Huang, Shenglong Zhou, Qi Chen, Zhiwei Xiong
- Abstract要約: マスク画像モデル(MIM)は,マスク画像から元の情報を復元する簡便さと有効性から広く利用されている。
本稿では、強化学習(RL)を利用して最適な画像マスキング比とマスキング戦略を自動検索する決定に基づくMIMを提案する。
本手法は,ニューロン分節の課題において,代替自己監督法に対して有意な優位性を有する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 53.00683059396803
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The performance of existing supervised neuron segmentation methods is highly
dependent on the number of accurate annotations, especially when applied to
large scale electron microscopy (EM) data. By extracting semantic information
from unlabeled data, self-supervised methods can improve the performance of
downstream tasks, among which the mask image model (MIM) has been widely used
due to its simplicity and effectiveness in recovering original information from
masked images. However, due to the high degree of structural locality in EM
images, as well as the existence of considerable noise, many voxels contain
little discriminative information, making MIM pretraining inefficient on the
neuron segmentation task. To overcome this challenge, we propose a
decision-based MIM that utilizes reinforcement learning (RL) to automatically
search for optimal image masking ratio and masking strategy. Due to the vast
exploration space, using single-agent RL for voxel prediction is impractical.
Therefore, we treat each input patch as an agent with a shared behavior policy,
allowing for multi-agent collaboration. Furthermore, this multi-agent model can
capture dependencies between voxels, which is beneficial for the downstream
segmentation task. Experiments conducted on representative EM datasets
demonstrate that our approach has a significant advantage over alternative
self-supervised methods on the task of neuron segmentation. Code is available
at \url{https://github.com/ydchen0806/dbMiM}.
- Abstract(参考訳): 既存の教師付きニューロンセグメンテーション法の性能は、特に大規模電子顕微鏡(em)データに適用する場合、正確なアノテーションの数に大きく依存する。
ラベルなしデータから意味情報を抽出することにより,マスク画像モデル (mim) がマスク画像からオリジナル情報を回収する上での単純さと有効性から広く利用されている下流タスクの性能を向上させることができる。
しかし、EM画像の構造的局所性の高さやかなりのノイズの存在により、多くのボクセルは識別情報をほとんど含まないため、MIM前訓練はニューロンセグメンテーションタスクにおいて非効率である。
この課題を克服するために、強化学習(RL)を利用して最適な画像マスキング比とマスキング戦略を自動検索する決定に基づくMIMを提案する。
広大な探査空間のため、ボクセル予測に単一エージェントRLを用いるのは現実的ではない。
そこで我々は,各入力パッチを共有行動ポリシーを持つエージェントとして扱い,マルチエージェント協調を可能にする。
さらに、このマルチエージェントモデルは、下流セグメンテーションタスクに有利なボクセル間の依存関係をキャプチャすることができる。
代表的EMデータセットを用いて行った実験は,ニューロン分節のタスクにおいて,我々のアプローチが代替的な自己監督手法よりも有意な優位性を示した。
コードは \url{https://github.com/ydchen0806/dbMiM} で入手できる。
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