論文の概要: Domain-invariant Clinical Representation Learning by Bridging Data
Distribution Shift across EMR Datasets
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.07799v2
- Date: Thu, 25 Jan 2024 18:00:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-26 17:50:30.278347
- Title: Domain-invariant Clinical Representation Learning by Bridging Data
Distribution Shift across EMR Datasets
- Title(参考訳): EMRデータセット間のデータ分散シフトのブリッジングによるドメイン不変な臨床表現学習
- Authors: Zhongji Zhang, Yuhang Wang, Yinghao Zhu, Xinyu Ma, Tianlong Wang,
Chaohe Zhang, Yasha Wang, Liantao Ma
- Abstract要約: 適切な診断を行い、パーソナライズされた治療計画を設計する上で、効果的な予後モデルが期待されている。
疾患の初期段階では、限られたデータ収集と臨床経験に加えて、プライバシと倫理の懸念から、参照のためのデータ可用性が制限される可能性がある。
本稿では、ソースデータセットからターゲットデータセットへの遷移モデルを構築するためのドメイン不変表現学習手法を紹介する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.317118701435742
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Due to the limited information about emerging diseases, symptoms are hard to
be noticed and recognized, so that the window for clinical intervention could
be ignored. An effective prognostic model is expected to assist doctors in
making right diagnosis and designing personalized treatment plan, so to
promptly prevent unfavorable outcomes. However, in the early stage of a
disease, limited data collection and clinical experiences, plus the concern out
of privacy and ethics, may result in restricted data availability for
reference, to the extent that even data labels are difficult to mark correctly.
In addition, Electronic Medical Record (EMR) data of different diseases or of
different sources of the same disease can prove to be having serious
cross-dataset feature misalignment problems, greatly mutilating the efficiency
of deep learning models. This article introduces a domain-invariant
representation learning method to build a transition model from source dataset
to target dataset. By way of constraining the distribution shift of features
generated in disparate domains, domain-invariant features that are exclusively
relative to downstream tasks are captured, so to cultivate a unified
domain-invariant encoder across various task domains to achieve better feature
representation. Experimental results of several target tasks demonstrate that
our proposed model outperforms competing baseline methods and has higher rate
of training convergence, especially in dealing with limited data amount. A
multitude of experiences have proven the efficacy of our method to provide more
accurate predictions concerning newly emergent pandemics and other diseases.
- Abstract(参考訳): 新興疾患に関する情報が限られているため、症状の認識や認識が困難であるため、臨床介入の窓は無視できる。
適切な診断とパーソナライズされた治療計画の策定を支援するために,効果的な予後モデルが期待されている。
しかしながら、疾患の初期段階では、データ収集と臨床経験の制限と、プライバシや倫理上の懸念により、参照のためのデータ可用性が制限され、データラベルさえ正しくマークすることが困難になる可能性がある。
さらに、異なる疾患の電子カルテ(EMR)データや同一疾患の異なるソースの電子カルテ(EMR)データは、深刻なクロスデータセットの特徴的不整合の問題があり、深層学習モデルの効率を大幅に損なう可能性がある。
本稿では、ソースデータセットからターゲットデータセットへの遷移モデルを構築するためのドメイン不変表現学習手法を紹介する。
異なる領域で発生する特徴の分布シフトを制限することにより、下流タスクにのみ相対するドメイン不変な特徴をキャプチャし、様々なタスク領域にまたがる統一ドメイン不変エンコーダを育成し、より優れた特徴表現を実現する。
いくつかの目標タスクの実験結果から,提案モデルが競合するベースライン法より優れ,特に限られたデータ量を扱う場合のトレーニング収束率が高いことが示された。
新たに発生したパンデミックやその他の病気について,より正確な予測を行うための手法の有効性を,数多くの経験から証明した。
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