論文の概要: One-hot Generalized Linear Model for Switching Brain State Discovery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.15263v1
- Date: Mon, 23 Oct 2023 18:10:22 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-25 22:25:08.244366
- Title: One-hot Generalized Linear Model for Switching Brain State Discovery
- Title(参考訳): ワンホット一般化線形モデルによる脳状態発見の切り替え
- Authors: Chengrui Li, Soon Ho Kim, Chris Rodgers, Hannah Choi, Anqi Wu
- Abstract要約: 神経信号からの推論された神経相互作用は、主に機能的相互作用を反映する。
学習した前者は状態-状態相互作用を捉え、基礎となる解剖学的コネクトームに光を当てるべきであることを示す。
本手法は,シミュレーションデータにおける真の相互作用構造を効果的に復元し,実際のニューラルネットワークで最高の予測可能性を獲得し,相互作用構造や隠れ状態をより解釈可能なものにする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.0132677989820746
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Exposing meaningful and interpretable neural interactions is critical to
understanding neural circuits. Inferred neural interactions from neural signals
primarily reflect functional interactions. In a long experiment, subject
animals may experience different stages defined by the experiment, stimuli, or
behavioral states, and hence functional interactions can change over time. To
model dynamically changing functional interactions, prior work employs
state-switching generalized linear models with hidden Markov models (i.e.,
HMM-GLMs). However, we argue they lack biological plausibility, as functional
interactions are shaped and confined by the underlying anatomical connectome.
Here, we propose a novel prior-informed state-switching GLM. We introduce both
a Gaussian prior and a one-hot prior over the GLM in each state. The priors are
learnable. We will show that the learned prior should capture the
state-constant interaction, shedding light on the underlying anatomical
connectome and revealing more likely physical neuron interactions. The
state-dependent interaction modeled by each GLM offers traceability to capture
functional variations across multiple brain states. Our methods effectively
recover true interaction structures in simulated data, achieve the highest
predictive likelihood with real neural datasets, and render interaction
structures and hidden states more interpretable when applied to real neural
data.
- Abstract(参考訳): 有意義で解釈可能な神経相互作用を明らかにすることは、神経回路を理解する上で重要である。
神経信号からの推論された神経相互作用は、主に機能的相互作用を反映する。
長い実験では、対象動物は実験、刺激、行動状態によって定義された異なる段階を経験し、したがって機能的相互作用は時間とともに変化する。
動的に変化する機能的相互作用をモデル化するために、先行研究では隠れマルコフモデル(HMM-GLM)を持つ状態スイッチング一般化線形モデルを採用している。
しかし、機能的相互作用は解剖学的コネクトームによって形作られ、閉じ込められているため、生物学的な可能性に欠けると主張する。
本稿では, 先行インフォームド・ステートスイッチング GLM を提案する。
各状態においてGLMよりもガウス先行と1ホット先行の両方を導入する。
前科は学習可能。
学習した前者は、状態と状態の相互作用を捉え、基礎となる解剖学的コネクトームに光を流し、より物理的な相互作用を示すべきであることを示す。
各GLMによってモデル化された状態依存相互作用は、複数の脳状態にわたる機能的変動を捉えるトレーサビリティを提供する。
本手法は,シミュレーションデータにおける真のインタラクション構造を効果的に復元し,実際のニューラルネットワークで最大予測可能性を達成し,実際のニューラルネットワークに適用した場合のインタラクション構造と隠れた状態をより解釈しやすいものにする。
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