論文の概要: Improving Performance in Colorectal Cancer Histology Decomposition using
Deep and Ensemble Machine Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.16954v1
- Date: Wed, 25 Oct 2023 19:46:27 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-27 23:34:32.713249
- Title: Improving Performance in Colorectal Cancer Histology Decomposition using
Deep and Ensemble Machine Learning
- Title(参考訳): Deep and Ensemble Machine Learning を用いた大腸癌組織分離術の性能改善
- Authors: Fabi Prezja, Leevi Annala, Sampsa Kiiskinen, Suvi Lahtinen, Timo
Ojala, Pekka Ruusuvuori, Teijo Kuopio
- Abstract要約: 組織学的にヘマトキシリンとエオシンで染色されたサンプルは、一般的に大腸癌管理に用いられている。
近年の研究では、手軽に利用できる画像から臨床関連バイオマーカーの抽出を容易にするための畳み込みニューラルネットワーク(CNN)の可能性を強調している。
CNNベースのバイオマーカーは、スピード、自動化、最小コストの利点を付加して、患者の結果をゴールデンスタンダードと同等に予測することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.7437806321813133
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In routine colorectal cancer management, histologic samples stained with
hematoxylin and eosin are commonly used. Nonetheless, their potential for
defining objective biomarkers for patient stratification and treatment
selection is still being explored. The current gold standard relies on
expensive and time-consuming genetic tests. However, recent research highlights
the potential of convolutional neural networks (CNNs) in facilitating the
extraction of clinically relevant biomarkers from these readily available
images. These CNN-based biomarkers can predict patient outcomes comparably to
golden standards, with the added advantages of speed, automation, and minimal
cost. The predictive potential of CNN-based biomarkers fundamentally relies on
the ability of convolutional neural networks (CNNs) to classify diverse tissue
types from whole slide microscope images accurately. Consequently, enhancing
the accuracy of tissue class decomposition is critical to amplifying the
prognostic potential of imaging-based biomarkers. This study introduces a
hybrid Deep and ensemble machine learning model that surpassed all preceding
solutions for this classification task. Our model achieved 96.74% accuracy on
the external test set and 99.89% on the internal test set. Recognizing the
potential of these models in advancing the task, we have made them publicly
available for further research and development.
- Abstract(参考訳): 定期的な大腸癌管理では、ヘマトキシリンとエオシンで染色した組織学的サンプルが一般的に用いられる。
それでも、患者層化と治療選択のための客観的なバイオマーカーを定義する可能性はまだ検討されている。
現在の金の基準は高価で時間を要する遺伝子検査に依存している。
しかし,最近の研究では,これらの画像から臨床関連バイオマーカーの抽出を容易にするための畳み込みニューラルネットワーク(CNN)の可能性を強調している。
これらのCNNベースのバイオマーカーは、スピード、自動化、最小コストの利点を付加して、患者の結果がゴールデンスタンダードと同等に予測できる。
CNNベースのバイオマーカーの予測可能性は基本的に、スライド顕微鏡画像全体から様々な組織タイプを正確に分類する畳み込みニューラルネットワーク(CNN)の機能に依存する。
したがって、組織クラスの分解の精度を高めることは、イメージングベースのバイオマーカーの予後を増幅するために重要である。
本研究は,この分類タスクにおいて,先行するすべての解を超越した,ハイブリッドな深層およびアンサンブル型機械学習モデルを提案する。
本モデルは,外部テストセットでは96.74%,内部テストセットでは99.89%の精度を示した。
これらのモデルがタスクを前進させる可能性を認識し、さらなる研究と開発のために公開しました。
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