論文の概要: Continual atlas-based segmentation of prostate MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.00548v2
- Date: Thu, 2 Nov 2023 15:30:59 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-03 10:18:29.271318
- Title: Continual atlas-based segmentation of prostate MRI
- Title(参考訳): 前立腺MRIの連続的アトラスによるセグメンテーション
- Authors: Amin Ranem, Camila Gonz\'alez, Daniel Pinto dos Santos, Andreas
Michael Bucher, Ahmed Ezzat Othman, Anirban Mukhopadhyay
- Abstract要約: 自然な画像分類のために設計された連続学習(CL)法は、しばしば基本的な品質基準に達しない。
我々は,プロトタイプを用いて高品質なセグメンテーションマスクを生成するアトラスベースのセグメンテーション手法であるAtlas Replayを提案する。
我々の結果は、Atlas Replayは堅牢であり、知識を維持しながら、まだ見つからない領域に対してうまく一般化していることを示している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.17257168063257
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Continual learning (CL) methods designed for natural image classification
often fail to reach basic quality standards for medical image segmentation.
Atlas-based segmentation, a well-established approach in medical imaging,
incorporates domain knowledge on the region of interest, leading to
semantically coherent predictions. This is especially promising for CL, as it
allows us to leverage structural information and strike an optimal balance
between model rigidity and plasticity over time. When combined with
privacy-preserving prototypes, this process offers the advantages of
rehearsal-based CL without compromising patient privacy. We propose Atlas
Replay, an atlas-based segmentation approach that uses prototypes to generate
high-quality segmentation masks through image registration that maintain
consistency even as the training distribution changes. We explore how our
proposed method performs compared to state-of-the-art CL methods in terms of
knowledge transferability across seven publicly available prostate segmentation
datasets. Prostate segmentation plays a vital role in diagnosing prostate
cancer, however, it poses challenges due to substantial anatomical variations,
benign structural differences in older age groups, and fluctuating acquisition
parameters. Our results show that Atlas Replay is both robust and generalizes
well to yet-unseen domains while being able to maintain knowledge, unlike
end-to-end segmentation methods. Our code base is available under
https://github.com/MECLabTUDA/Atlas-Replay.
- Abstract(参考訳): 自然画像分類のための連続学習(cl)手法は、医用画像分割の基本品質基準に達しないことが多い。
アトラスに基づくセグメンテーション(Atlas-based segmentation)は、医用画像において確立されたアプローチであり、関心領域に関するドメイン知識を取り入れ、意味的に一貫性のある予測をもたらす。
これはCLにとって特に有望であり、構造情報を活用し、時間とともにモデル剛性と塑性の最適なバランスをとることができる。
プライバシ保存プロトタイプと組み合わせることで、このプロセスは患者のプライバシを損なうことなく、リハーサルベースのclの利点を提供する。
我々は,アトラスを用いたセグメンテーション手法であるAtlas Replayを提案し,トレーニング分布が変化しても整合性を維持する画像登録により,プロトタイプを用いて高品質セグメンテーションマスクを生成する。
提案手法は,7つのプレステートセグメンテーションデータセット間の知識伝達可能性の観点から,最先端のCL手法と比較してどのように機能するかを考察する。
前立腺セグメンテーションは前立腺がんの診断において重要な役割を担っているが、解剖学的変異、高齢者群の構造的相違、獲得パラメータの変動などにより課題が生じる。
その結果,atlas replayは,エンド・ツー・エンドのセグメンテーション手法とは異なり,知識を維持しつつ,未熟な領域に十分に一般化できることがわかった。
私たちのコードベースはhttps://github.com/MECLabTUDA/Atlas-Replayで利用可能です。
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