論文の概要: Improving Lesion Segmentation in FDG-18 Whole-Body PET/CT scans using
Multilabel approach: AutoPET II challenge
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.01574v1
- Date: Thu, 2 Nov 2023 19:51:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-06 16:03:08.999839
- Title: Improving Lesion Segmentation in FDG-18 Whole-Body PET/CT scans using
Multilabel approach: AutoPET II challenge
- Title(参考訳): マルチラベルアプローチによるFDG-18全体PET/CTスキャンにおける病変セグメンテーションの改善:オートPETIIの課題
- Authors: Gowtham Krishnan Murugesan, Diana McCrumb, Eric Brunner, Jithendra
Kumar, Rahul Soni, Vasily Grigorash, Stephen Moore, and Jeff Van Oss
- Abstract要約: 肝臓、脾臓、脳、膀胱などの放射性物質の取り込みが増加する臓器の存在は、しばしば課題に繋がる。
本稿では, 臓器と病変のセグメンテーションに新たなアプローチを提案し, 自動病変セグメンテーション法の性能を高めることを目的とする。
以上の結果から,本手法がテストデータセットの上位ランキングを達成できたことが示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.039550447522409014
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Automatic segmentation of lesions in FDG-18 Whole Body (WB) PET/CT scans
using deep learning models is instrumental for determining treatment response,
optimizing dosimetry, and advancing theranostic applications in oncology.
However, the presence of organs with elevated radiotracer uptake, such as the
liver, spleen, brain, and bladder, often leads to challenges, as these regions
are often misidentified as lesions by deep learning models. To address this
issue, we propose a novel approach of segmenting both organs and lesions,
aiming to enhance the performance of automatic lesion segmentation methods. In
this study, we assessed the effectiveness of our proposed method using the
AutoPET II challenge dataset, which comprises 1014 subjects. We evaluated the
impact of inclusion of additional labels and data in the segmentation
performance of the model. In addition to the expert-annotated lesion labels, we
introduced eight additional labels for organs, including the liver, kidneys,
urinary bladder, spleen, lung, brain, heart, and stomach. These labels were
integrated into the dataset, and a 3D UNET model was trained within the nnUNet
framework. Our results demonstrate that our method achieved the top ranking in
the held-out test dataset, underscoring the potential of this approach to
significantly improve lesion segmentation accuracy in FDG-18 Whole-Body PET/CT
scans, ultimately benefiting cancer patients and advancing clinical practice.
- Abstract(参考訳): 深層学習モデルを用いたFDG-18全体PET/CTスキャンにおける病変の自動分離は、治療反応の判定、ドシメトリの最適化、腫瘍学における脳新生の応用の進展に有効である。
しかし、肝臓、脾臓、脳、膀胱などの放射線吸収が増加する臓器の存在は、これらの領域が深層学習モデルによる病変と誤認されることがしばしばあるため、しばしば課題となる。
そこで本研究では,臓器と病変の両方を分節する新たなアプローチを提案し,自動的病変分節法の性能向上を目指した。
本研究では1014名の被験者からなるAutoPET IIチャレンジデータセットを用いて,提案手法の有効性を検討した。
モデルのセグメンテーション性能におけるラベルとデータの追加が与える影響について検討した。
専門的病変ラベルに加えて,肝,腎臓,膀胱,脾臓,肺,脳,心臓,胃の8つの臓器ラベルを導入した。
これらのラベルはデータセットに統合され、3D UNETモデルはnnUNetフレームワーク内でトレーニングされた。
その結果,本手法はfdg-18全身pet/ctスキャンにおける病変分画精度を著しく向上させる可能性があり,最終的にがん患者に利益をもたらし,臨床実践の進展に繋がる可能性が示唆された。
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