論文の概要: Peptide Binding Classification on Quantum Computers
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.15696v1
- Date: Mon, 27 Nov 2023 10:32:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-28 16:14:25.354196
- Title: Peptide Binding Classification on Quantum Computers
- Title(参考訳): 量子コンピュータにおけるペプチド結合分類
- Authors: Charles London, Douglas Brown, Wenduan Xu, Sezen Vatansever,
Christopher James Langmead, Dimitri Kartsaklis, Stephen Clark, Konstantinos
Meichanetzidis
- Abstract要約: 本研究では,計算生物学の分野における課題として,短期量子コンピュータを用いた広範囲な研究を行っている。
治療タンパク質の設計に関わる課題に対してシーケンス分類を行い、類似スケールの古典的ベースラインと競合する性能を示す。
この研究は、治療タンパク質の設計に不可欠なタスクに対して、短期量子コンピューティングの最初の概念実証アプリケーションを構成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.9540968630765643
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We conduct an extensive study on using near-term quantum computers for a task
in the domain of computational biology. By constructing quantum models based on
parameterised quantum circuits we perform sequence classification on a task
relevant to the design of therapeutic proteins, and find competitive
performance with classical baselines of similar scale. To study the effect of
noise, we run some of the best-performing quantum models with favourable
resource requirements on emulators of state-of-the-art noisy quantum
processors. We then apply error mitigation methods to improve the signal. We
further execute these quantum models on the Quantinuum H1-1 trapped-ion quantum
processor and observe very close agreement with noiseless exact simulation.
Finally, we perform feature attribution methods and find that the quantum
models indeed identify sensible relationships, at least as well as the
classical baselines. This work constitutes the first proof-of-concept
application of near-term quantum computing to a task critical to the design of
therapeutic proteins, opening the route toward larger-scale applications in
this and related fields, in line with the hardware development roadmaps of
near-term quantum technologies.
- Abstract(参考訳): 計算生物学の分野におけるタスクとして,短期量子コンピュータの利用に関する広範な研究を行う。
パラメータ化された量子回路に基づく量子モデルを構築することにより、治療タンパク質の設計に関連するタスクのシーケンス分類を行い、同様のスケールの古典的ベースラインと競合性を見出す。
ノイズの影響を調べるため、最先端のノイズ量子プロセッサのエミュレータ上で、最適なリソース要求を持つ最高の量子モデルを実行する。
次に,信号改善のために誤り軽減手法を適用する。
我々は、これらの量子モデルを量子H1-1トラップイオン量子プロセッサ上でさらに実行し、ノイズのない正確なシミュレーションと非常に密接な一致を観察する。
最後に、特徴帰属法を行い、量子モデルは、少なくとも古典的ベースラインと同様に、実際に有意義な関係を同定する。
この研究は、治療タンパク質の設計に不可欠なタスクに対して、短期量子コンピューティングの最初の概念実証アプリケーションを構成し、近未来の量子技術のハードウェア開発ロードマップに従って、これと関連分野における大規模アプリケーションへの道を開く。
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