論文の概要: Augmenting x-ray single particle imaging reconstruction with
self-supervised machine learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.16652v1
- Date: Tue, 28 Nov 2023 10:05:44 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-29 18:57:07.136985
- Title: Augmenting x-ray single particle imaging reconstruction with
self-supervised machine learning
- Title(参考訳): 自己教師型機械学習によるX線単一粒子画像再構成
- Authors: Zhantao Chen, Cong Wang, Mingye Gao, Chun Hong Yoon, Jana B. Thayer,
Joshua J. Turner
- Abstract要約: 粒子配向を復元し、回折画像のみから相互空間強度を推定するエンド・ツー・エンドの自己教師型機械学習手法を提案する。
提案手法は,従来のアルゴリズムと比較して,再現性を大幅に向上した実験条件下での強靭性を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.109422776828829
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The development of X-ray Free Electron Lasers (XFELs) has opened numerous
opportunities to probe atomic structure and ultrafast dynamics of various
materials. Single Particle Imaging (SPI) with XFELs enables the investigation
of biological particles in their natural physiological states with unparalleled
temporal resolution, while circumventing the need for cryogenic conditions or
crystallization. However, reconstructing real-space structures from
reciprocal-space x-ray diffraction data is highly challenging due to the
absence of phase and orientation information, which is further complicated by
weak scattering signals and considerable fluctuations in the number of photons
per pulse. In this work, we present an end-to-end, self-supervised machine
learning approach to recover particle orientations and estimate reciprocal
space intensities from diffraction images only. Our method demonstrates great
robustness under demanding experimental conditions with significantly enhanced
reconstruction capabilities compared with conventional algorithms, and
signifies a paradigm shift in SPI as currently practiced at XFELs.
- Abstract(参考訳): x線自由電子レーザー(xfels)の開発は、様々な材料の原子構造と超高速ダイナミクスを調べる多くの機会を開いた。
XFELを用いた単一粒子イメージング(SPI)は、低温条件や結晶化の必要性を回避しつつ、時間分解能のない自然生理状態における生物学的粒子の研究を可能にする。
しかし、逆空間x線回折データからの実空間構造を再構成することは位相情報や方位情報がないため非常に困難であり、弱い散乱信号やパルス当たりの光子数のかなりの変動によりさらに複雑である。
本研究では, 粒子配向を回復し, 回折画像のみから相互空間強度を推定するための, エンドツーエンドの自己教師付き機械学習手法を提案する。
提案手法は, 従来のアルゴリズムと比べ, 再構成能力が大幅に向上した実験条件下では, 高い堅牢性を示し, XFELで実施されているSPIのパラダイムシフトを示す。
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